Protein–RNA interactions for Protein: Q6SA08

TSSK4, Testis-specific serine/threonine-protein kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSSK4Q6SA08 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TSSK4Q6SA08 AC103691.2-201ENST00000618824 433 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
TSSK4Q6SA08 AL805961.1-201ENST00000642026 753 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
TSSK4Q6SA08 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
TSSK4Q6SA08 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TSSK4Q6SA08 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TSSK4Q6SA08 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TSSK4Q6SA08 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TSSK4Q6SA08 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TSSK4Q6SA08 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TSSK4Q6SA08 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TSSK4Q6SA08 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TSSK4Q6SA08 OR6A2-201ENST00000332601 1373 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TSSK4Q6SA08 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TSSK4Q6SA08 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TSSK4Q6SA08 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TSSK4Q6SA08 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TSSK4Q6SA08 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TSSK4Q6SA08 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TSSK4Q6SA08 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TSSK4Q6SA08 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TSSK4Q6SA08 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TSSK4Q6SA08 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TSSK4Q6SA08 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TSSK4Q6SA08 ATP6V0E2-207ENST00000479613 1666 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TSSK4Q6SA08 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TSSK4Q6SA08 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TSSK4Q6SA08 SCML4-201ENST00000369020 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TSSK4Q6SA08 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TSSK4Q6SA08 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TSSK4Q6SA08 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TSSK4Q6SA08 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TSSK4Q6SA08 RHOXF1-201ENST00000217999 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TSSK4Q6SA08 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TSSK4Q6SA08 MRPL55-214ENST00000366741 603 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TSSK4Q6SA08 MRPL55-218ENST00000366747 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TSSK4Q6SA08 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
TSSK4Q6SA08 MRPL23-204ENST00000397297 613 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TSSK4Q6SA08 HNRNPA1P41-201ENST00000397777 928 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
TSSK4Q6SA08 ISCA2P1-201ENST00000425548 448 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
TSSK4Q6SA08 AL450469.2-201ENST00000427132 499 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TSSK4Q6SA08 AL109767.1-201ENST00000429450 564 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TSSK4Q6SA08 TUBB8P8-201ENST00000458717 1058 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
TSSK4Q6SA08 RN7SL8P-201ENST00000461771 266 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
TSSK4Q6SA08 SZRD1-203ENST00000471507 892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TSSK4Q6SA08 RBM4B-202ENST00000524637 867 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TSSK4Q6SA08 SIRT3-210ENST00000529382 1225 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TSSK4Q6SA08 CDIP1-202ENST00000562334 1205 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TSSK4Q6SA08 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TSSK4Q6SA08 AL031282.1-201ENST00000577672 409 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TSSK4Q6SA08 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TSSK4Q6SA08 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
TSSK4Q6SA08 AC009084.3-201ENST00000623356 437 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
TSSK4Q6SA08 AC006453.1-201ENST00000636037 1257 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
TSSK4Q6SA08 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TSSK4Q6SA08 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TSSK4Q6SA08 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TSSK4Q6SA08 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TSSK4Q6SA08 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TSSK4Q6SA08 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TSSK4Q6SA08 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TSSK4Q6SA08 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TSSK4Q6SA08 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TSSK4Q6SA08 SERPING1-204ENST00000378324 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TSSK4Q6SA08 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TSSK4Q6SA08 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
TSSK4Q6SA08 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TSSK4Q6SA08 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TSSK4Q6SA08 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TSSK4Q6SA08 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TSSK4Q6SA08 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TSSK4Q6SA08 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TSSK4Q6SA08 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TSSK4Q6SA08 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TSSK4Q6SA08 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TSSK4Q6SA08 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TSSK4Q6SA08 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TSSK4Q6SA08 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TSSK4Q6SA08 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TSSK4Q6SA08 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TSSK4Q6SA08 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TSSK4Q6SA08 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TSSK4Q6SA08 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TSSK4Q6SA08 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TSSK4Q6SA08 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TSSK4Q6SA08 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TSSK4Q6SA08 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TSSK4Q6SA08 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TSSK4Q6SA08 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TSSK4Q6SA08 PDE6G-201ENST00000331056 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TSSK4Q6SA08 ZDHHC4-201ENST00000335965 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TSSK4Q6SA08 ALG1L-201ENST00000340333 805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TSSK4Q6SA08 CELA2B-201ENST00000375910 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TSSK4Q6SA08 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
TSSK4Q6SA08 PIK3IP1-202ENST00000402249 999 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TSSK4Q6SA08 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TSSK4Q6SA08 AL353637.1-201ENST00000451571 732 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
TSSK4Q6SA08 AC090857.1-201ENST00000527400 390 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
TSSK4Q6SA08 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TSSK4Q6SA08 PGAM1P5-201ENST00000548011 764 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms