Protein–RNA interactions for Protein: Q6PIJ6

FBXO38, F-box only protein 38, humanhuman

Predictions only

Length 1,188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO38Q6PIJ6 MLXIPL-204ENST00000414749 3224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FBXO38Q6PIJ6 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FBXO38Q6PIJ6 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
FBXO38Q6PIJ6 CORO7-201ENST00000251166 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FBXO38Q6PIJ6 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FBXO38Q6PIJ6 HADH-202ENST00000403312 1752 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
FBXO38Q6PIJ6 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
FBXO38Q6PIJ6 TK2-221ENST00000620035 5060 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
FBXO38Q6PIJ6 SSTR1-201ENST00000267377 4295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
FBXO38Q6PIJ6 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FBXO38Q6PIJ6 FLI1-201ENST00000281428 4151 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FBXO38Q6PIJ6 TOLLIP-202ENST00000317204 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FBXO38Q6PIJ6 SNX19-211ENST00000533214 3096 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FBXO38Q6PIJ6 DNAJB6-201ENST00000262177 2527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FBXO38Q6PIJ6 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
FBXO38Q6PIJ6 ESPN-201ENST00000377828 3531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FBXO38Q6PIJ6 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FBXO38Q6PIJ6 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FBXO38Q6PIJ6 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
FBXO38Q6PIJ6 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
FBXO38Q6PIJ6 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
FBXO38Q6PIJ6 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FBXO38Q6PIJ6 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
FBXO38Q6PIJ6 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
FBXO38Q6PIJ6 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
FBXO38Q6PIJ6 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
FBXO38Q6PIJ6 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
FBXO38Q6PIJ6 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
FBXO38Q6PIJ6 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
FBXO38Q6PIJ6 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FBXO38Q6PIJ6 NLRP7-209ENST00000592784 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FBXO38Q6PIJ6 SNAP29-201ENST00000215730 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FBXO38Q6PIJ6 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
FBXO38Q6PIJ6 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
FBXO38Q6PIJ6 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
FBXO38Q6PIJ6 LRRC20-201ENST00000355790 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FBXO38Q6PIJ6 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
FBXO38Q6PIJ6 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FBXO38Q6PIJ6 PAPSS2-202ENST00000456849 3856 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FBXO38Q6PIJ6 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FBXO38Q6PIJ6 ARHGAP45-202ENST00000539243 4184 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
FBXO38Q6PIJ6 AL591122.2-201ENST00000624125 1853 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
FBXO38Q6PIJ6 LINC00479-201ENST00000412102 2033 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
FBXO38Q6PIJ6 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FBXO38Q6PIJ6 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
FBXO38Q6PIJ6 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FBXO38Q6PIJ6 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
FBXO38Q6PIJ6 PPM1M-201ENST00000296487 2429 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
FBXO38Q6PIJ6 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
FBXO38Q6PIJ6 GRIN2C-201ENST00000293190 4261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
FBXO38Q6PIJ6 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
FBXO38Q6PIJ6 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
FBXO38Q6PIJ6 AC015712.2-202ENST00000560068 3213 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
FBXO38Q6PIJ6 ZBED6CL-201ENST00000343855 2933 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
FBXO38Q6PIJ6 FLII-201ENST00000327031 4338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
FBXO38Q6PIJ6 USP44-203ENST00000537435 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
FBXO38Q6PIJ6 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
FBXO38Q6PIJ6 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
FBXO38Q6PIJ6 SLC35C2-203ENST00000372227 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
FBXO38Q6PIJ6 WDR59-201ENST00000262144 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
FBXO38Q6PIJ6 MYH14-201ENST00000262269 3848 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
FBXO38Q6PIJ6 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
FBXO38Q6PIJ6 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
FBXO38Q6PIJ6 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
FBXO38Q6PIJ6 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
FBXO38Q6PIJ6 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
FBXO38Q6PIJ6 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
FBXO38Q6PIJ6 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
FBXO38Q6PIJ6 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
FBXO38Q6PIJ6 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
FBXO38Q6PIJ6 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
FBXO38Q6PIJ6 C7orf57-204ENST00000435376 1925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
FBXO38Q6PIJ6 C7orf57-206ENST00000539619 1927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
FBXO38Q6PIJ6 PPIL6-202ENST00000424445 4031 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
FBXO38Q6PIJ6 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
FBXO38Q6PIJ6 INF2-203ENST00000392634 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
FBXO38Q6PIJ6 KIFC3-204ENST00000465878 3225 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
FBXO38Q6PIJ6 DPP8-202ENST00000321147 3125 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
FBXO38Q6PIJ6 JPH3-201ENST00000284262 3985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
FBXO38Q6PIJ6 KRT75-201ENST00000252245 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
FBXO38Q6PIJ6 RPN2-202ENST00000373622 2348 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
FBXO38Q6PIJ6 PCDHA5-201ENST00000529619 4157 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
FBXO38Q6PIJ6 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
FBXO38Q6PIJ6 TBC1D24-207ENST00000627285 4382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
FBXO38Q6PIJ6 ZNRF3-202ENST00000406323 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
FBXO38Q6PIJ6 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
FBXO38Q6PIJ6 RGS3-208ENST00000394646 2716 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.22
FBXO38Q6PIJ6 RPS6KA1-213ENST00000526792 2596 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
FBXO38Q6PIJ6 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
FBXO38Q6PIJ6 PLTP-203ENST00000372431 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
FBXO38Q6PIJ6 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
FBXO38Q6PIJ6 SCD5-202ENST00000319540 3101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
FBXO38Q6PIJ6 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
FBXO38Q6PIJ6 OSBPL5-201ENST00000263650 3889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
FBXO38Q6PIJ6 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
FBXO38Q6PIJ6 TPM3-206ENST00000330188 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
FBXO38Q6PIJ6 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
FBXO38Q6PIJ6 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
FBXO38Q6PIJ6 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
FBXO38Q6PIJ6 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms