Protein–RNA interactions for Protein: Q5SW96

LDLRAP1, Low density lipoprotein receptor adapter protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LDLRAP1Q5SW96 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
LDLRAP1Q5SW96 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LDLRAP1Q5SW96 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LDLRAP1Q5SW96 KCTD3-201ENST00000259154 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LDLRAP1Q5SW96 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LDLRAP1Q5SW96 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LDLRAP1Q5SW96 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LDLRAP1Q5SW96 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LDLRAP1Q5SW96 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LDLRAP1Q5SW96 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LDLRAP1Q5SW96 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LDLRAP1Q5SW96 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LDLRAP1Q5SW96 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LDLRAP1Q5SW96 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LDLRAP1Q5SW96 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
LDLRAP1Q5SW96 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
LDLRAP1Q5SW96 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LDLRAP1Q5SW96 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LDLRAP1Q5SW96 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LDLRAP1Q5SW96 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
LDLRAP1Q5SW96 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LDLRAP1Q5SW96 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LDLRAP1Q5SW96 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LDLRAP1Q5SW96 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LDLRAP1Q5SW96 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
LDLRAP1Q5SW96 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LDLRAP1Q5SW96 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LDLRAP1Q5SW96 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LDLRAP1Q5SW96 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LDLRAP1Q5SW96 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LDLRAP1Q5SW96 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LDLRAP1Q5SW96 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LDLRAP1Q5SW96 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LDLRAP1Q5SW96 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LDLRAP1Q5SW96 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LDLRAP1Q5SW96 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LDLRAP1Q5SW96 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LDLRAP1Q5SW96 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LDLRAP1Q5SW96 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LDLRAP1Q5SW96 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LDLRAP1Q5SW96 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LDLRAP1Q5SW96 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LDLRAP1Q5SW96 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LDLRAP1Q5SW96 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LDLRAP1Q5SW96 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LDLRAP1Q5SW96 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LDLRAP1Q5SW96 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LDLRAP1Q5SW96 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LDLRAP1Q5SW96 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LDLRAP1Q5SW96 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LDLRAP1Q5SW96 TERT-201ENST00000310581 4018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LDLRAP1Q5SW96 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LDLRAP1Q5SW96 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LDLRAP1Q5SW96 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LDLRAP1Q5SW96 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LDLRAP1Q5SW96 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LDLRAP1Q5SW96 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LDLRAP1Q5SW96 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LDLRAP1Q5SW96 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LDLRAP1Q5SW96 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LDLRAP1Q5SW96 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LDLRAP1Q5SW96 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LDLRAP1Q5SW96 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
LDLRAP1Q5SW96 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LDLRAP1Q5SW96 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LDLRAP1Q5SW96 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LDLRAP1Q5SW96 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LDLRAP1Q5SW96 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LDLRAP1Q5SW96 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LDLRAP1Q5SW96 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LDLRAP1Q5SW96 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LDLRAP1Q5SW96 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
LDLRAP1Q5SW96 DMTN-201ENST00000265800 2554 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LDLRAP1Q5SW96 DMTN-207ENST00000517305 2551 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LDLRAP1Q5SW96 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LDLRAP1Q5SW96 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LDLRAP1Q5SW96 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LDLRAP1Q5SW96 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LDLRAP1Q5SW96 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LDLRAP1Q5SW96 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LDLRAP1Q5SW96 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LDLRAP1Q5SW96 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LDLRAP1Q5SW96 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LDLRAP1Q5SW96 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LDLRAP1Q5SW96 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LDLRAP1Q5SW96 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LDLRAP1Q5SW96 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LDLRAP1Q5SW96 SARM1-208ENST00000585482 10309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LDLRAP1Q5SW96 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LDLRAP1Q5SW96 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LDLRAP1Q5SW96 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LDLRAP1Q5SW96 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LDLRAP1Q5SW96 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LDLRAP1Q5SW96 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LDLRAP1Q5SW96 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LDLRAP1Q5SW96 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LDLRAP1Q5SW96 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LDLRAP1Q5SW96 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LDLRAP1Q5SW96 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LDLRAP1Q5SW96 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.5 ms