Protein–RNA interactions for Protein: Q5JVF3

PCID2, PCI domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCID2Q5JVF3 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCID2Q5JVF3 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCID2Q5JVF3 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCID2Q5JVF3 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCID2Q5JVF3 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCID2Q5JVF3 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCID2Q5JVF3 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCID2Q5JVF3 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PCID2Q5JVF3 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCID2Q5JVF3 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCID2Q5JVF3 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCID2Q5JVF3 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCID2Q5JVF3 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCID2Q5JVF3 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCID2Q5JVF3 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCID2Q5JVF3 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCID2Q5JVF3 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCID2Q5JVF3 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCID2Q5JVF3 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCID2Q5JVF3 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCID2Q5JVF3 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCID2Q5JVF3 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PCID2Q5JVF3 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCID2Q5JVF3 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCID2Q5JVF3 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCID2Q5JVF3 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PCID2Q5JVF3 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PCID2Q5JVF3 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCID2Q5JVF3 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCID2Q5JVF3 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PCID2Q5JVF3 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCID2Q5JVF3 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCID2Q5JVF3 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCID2Q5JVF3 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCID2Q5JVF3 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCID2Q5JVF3 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCID2Q5JVF3 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCID2Q5JVF3 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCID2Q5JVF3 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCID2Q5JVF3 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCID2Q5JVF3 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCID2Q5JVF3 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCID2Q5JVF3 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCID2Q5JVF3 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCID2Q5JVF3 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCID2Q5JVF3 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCID2Q5JVF3 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PCID2Q5JVF3 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PCID2Q5JVF3 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PCID2Q5JVF3 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PCID2Q5JVF3 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PCID2Q5JVF3 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PCID2Q5JVF3 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PCID2Q5JVF3 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PCID2Q5JVF3 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PCID2Q5JVF3 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PCID2Q5JVF3 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PCID2Q5JVF3 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PCID2Q5JVF3 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PCID2Q5JVF3 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PCID2Q5JVF3 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PCID2Q5JVF3 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PCID2Q5JVF3 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PCID2Q5JVF3 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PCID2Q5JVF3 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PCID2Q5JVF3 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PCID2Q5JVF3 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PCID2Q5JVF3 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PCID2Q5JVF3 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PCID2Q5JVF3 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PCID2Q5JVF3 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PCID2Q5JVF3 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PCID2Q5JVF3 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PCID2Q5JVF3 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PCID2Q5JVF3 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PCID2Q5JVF3 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PCID2Q5JVF3 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PCID2Q5JVF3 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PCID2Q5JVF3 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PCID2Q5JVF3 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PCID2Q5JVF3 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PCID2Q5JVF3 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PCID2Q5JVF3 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PCID2Q5JVF3 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PCID2Q5JVF3 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PCID2Q5JVF3 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PCID2Q5JVF3 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PCID2Q5JVF3 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PCID2Q5JVF3 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PCID2Q5JVF3 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PCID2Q5JVF3 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PCID2Q5JVF3 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PCID2Q5JVF3 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PCID2Q5JVF3 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PCID2Q5JVF3 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PCID2Q5JVF3 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PCID2Q5JVF3 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PCID2Q5JVF3 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PCID2Q5JVF3 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PCID2Q5JVF3 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms