Protein–RNA interactions for Protein: Q53GQ0

HSD17B12, Very-long-chain 3-oxoacyl-CoA reductase, humanhuman

Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSD17B12Q53GQ0 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
HSD17B12Q53GQ0 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
HSD17B12Q53GQ0 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
HSD17B12Q53GQ0 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
HSD17B12Q53GQ0 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
HSD17B12Q53GQ0 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
HSD17B12Q53GQ0 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
HSD17B12Q53GQ0 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
HSD17B12Q53GQ0 SEPT9-220ENST00000588690 2919 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
HSD17B12Q53GQ0 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
HSD17B12Q53GQ0 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
HSD17B12Q53GQ0 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
HSD17B12Q53GQ0 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
HSD17B12Q53GQ0 FGFR1-202ENST00000335922 4157 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
HSD17B12Q53GQ0 CNOT10-201ENST00000328834 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
HSD17B12Q53GQ0 RNF123-202ENST00000432042 2670 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
HSD17B12Q53GQ0 ARID4B-201ENST00000264183 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
HSD17B12Q53GQ0 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
HSD17B12Q53GQ0 TCAF1P1-201ENST00000414990 2232 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
HSD17B12Q53GQ0 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
HSD17B12Q53GQ0 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
HSD17B12Q53GQ0 ZBTB7B-207ENST00000535420 3777 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
HSD17B12Q53GQ0 FASN-201ENST00000306749 8565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
HSD17B12Q53GQ0 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
HSD17B12Q53GQ0 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
HSD17B12Q53GQ0 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
HSD17B12Q53GQ0 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
HSD17B12Q53GQ0 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
HSD17B12Q53GQ0 KDELR2-201ENST00000258739 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
HSD17B12Q53GQ0 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
HSD17B12Q53GQ0 RSPH9-202ENST00000372165 2586 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
HSD17B12Q53GQ0 MSL2-201ENST00000309993 4692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
HSD17B12Q53GQ0 DCUN1D4-202ENST00000381441 4207 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
HSD17B12Q53GQ0 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
HSD17B12Q53GQ0 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
HSD17B12Q53GQ0 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
HSD17B12Q53GQ0 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
HSD17B12Q53GQ0 DMTN-214ENST00000519907 2658 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
HSD17B12Q53GQ0 ATXN7-201ENST00000295900 7224 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
HSD17B12Q53GQ0 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
HSD17B12Q53GQ0 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
HSD17B12Q53GQ0 HTR3A-206ENST00000506841 2221 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
HSD17B12Q53GQ0 ABCA2-203ENST00000371605 8151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
HSD17B12Q53GQ0 TAOK2-204ENST00000543033 4072 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
HSD17B12Q53GQ0 PAPD7-207ENST00000631941 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
HSD17B12Q53GQ0 CUEDC1-206ENST00000577830 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
HSD17B12Q53GQ0 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
HSD17B12Q53GQ0 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
HSD17B12Q53GQ0 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
HSD17B12Q53GQ0 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC13.59□□□□□ -0.23
HSD17B12Q53GQ0 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
HSD17B12Q53GQ0 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
HSD17B12Q53GQ0 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
HSD17B12Q53GQ0 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
HSD17B12Q53GQ0 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
HSD17B12Q53GQ0 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
HSD17B12Q53GQ0 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
HSD17B12Q53GQ0 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
HSD17B12Q53GQ0 MN1-201ENST00000302326 7556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
HSD17B12Q53GQ0 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
HSD17B12Q53GQ0 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
HSD17B12Q53GQ0 ADAM11-201ENST00000200557 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
HSD17B12Q53GQ0 SAFB-201ENST00000292123 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
HSD17B12Q53GQ0 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
HSD17B12Q53GQ0 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
HSD17B12Q53GQ0 GPRASP1-203ENST00000444152 5809 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
HSD17B12Q53GQ0 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
HSD17B12Q53GQ0 ARID3B-201ENST00000346246 4271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
HSD17B12Q53GQ0 POLL-205ENST00000370169 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
HSD17B12Q53GQ0 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
HSD17B12Q53GQ0 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
HSD17B12Q53GQ0 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
HSD17B12Q53GQ0 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
HSD17B12Q53GQ0 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
HSD17B12Q53GQ0 SLC38A9-202ENST00000396865 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
HSD17B12Q53GQ0 PPIL2-202ENST00000398831 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
HSD17B12Q53GQ0 ITGAM-202ENST00000544665 4718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
HSD17B12Q53GQ0 NFATC4-219ENST00000555167 4364 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
HSD17B12Q53GQ0 EXTL1-201ENST00000374280 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
HSD17B12Q53GQ0 B3GNT7-201ENST00000287590 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
HSD17B12Q53GQ0 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
HSD17B12Q53GQ0 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
HSD17B12Q53GQ0 ADAM15-206ENST00000368412 2804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
HSD17B12Q53GQ0 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
HSD17B12Q53GQ0 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
HSD17B12Q53GQ0 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
HSD17B12Q53GQ0 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
HSD17B12Q53GQ0 MUTYH-210ENST00000450313 1929 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
HSD17B12Q53GQ0 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
HSD17B12Q53GQ0 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
HSD17B12Q53GQ0 PRKAG2-215ENST00000492843 2699 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
HSD17B12Q53GQ0 IRS1-201ENST00000305123 9705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
HSD17B12Q53GQ0 ACIN1-201ENST00000262710 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
HSD17B12Q53GQ0 RSPH9-201ENST00000372163 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
HSD17B12Q53GQ0 AL591623.1-201ENST00000417786 1960 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
HSD17B12Q53GQ0 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
HSD17B12Q53GQ0 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
HSD17B12Q53GQ0 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
HSD17B12Q53GQ0 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
HSD17B12Q53GQ0 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 169.8 ms