Protein–RNA interactions for Protein: Q3LI58

KRTAP21-1, Keratin-associated protein 21-1, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP21-1Q3LI58 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC2.36□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 INTS13-201ENST00000261191 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 EBF3-201ENST00000355311 2993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 AAAS-201ENST00000209873 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 SPATS2-203ENST00000547865 1810 ntTSL 2 BASIC2.36□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 CEACAM20-203ENST00000614924 1809 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 MDH2-204ENST00000443006 2020 ntTSL 2 BASIC2.36□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC2.36□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 KLHL13-207ENST00000540167 3396 ntTSL 2 BASIC2.36□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 ST3GAL6-228ENST00000613264 3399 ntTSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 RAVER1-206ENST00000611074 3586 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 CNOT4-203ENST00000361528 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 AGPAT1-203ENST00000375107 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC2.36□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 GPA33-201ENST00000367868 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 LRSAM1-203ENST00000373322 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC2.36□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 FAM214B-208ENST00000605244 3016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 SEMA7A-202ENST00000542748 3228 ntTSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 ADPRH-201ENST00000357003 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 CUEDC1-206ENST00000577830 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 TEX13B-201ENST00000302917 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.36□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 SNX15-201ENST00000352068 771 ntTSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.36□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.36□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC2.36□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.36□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC2.36□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 DMKN-204ENST00000408915 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 AF274855.1-203ENST00000424126 800 ntTSL 3 BASIC2.36□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 AL137856.1-201ENST00000429398 773 ntTSL 3 BASIC2.36□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC2.36□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 AL157373.2-201ENST00000437559 784 ntTSL 3 BASIC2.36□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC2.36□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 PFN1P12-201ENST00000455938 534 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 KLC4-205ENST00000458460 1251 ntTSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 AC009403.1-204ENST00000469539 597 ntTSL 2 BASIC2.36□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC2.36□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 DSCR3-207ENST00000476950 937 ntTSL 2 BASIC2.36□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 YIF1A-210ENST00000496746 667 ntTSL 2 BASIC2.36□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 AC090502.1-202ENST00000515416 966 ntTSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC2.36□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC2.36□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC2.36□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.36□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC2.36□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 PLEKHB1-206ENST00000535129 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC2.36□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC2.36□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC2.36□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 SNRPF-204ENST00000552085 815 ntTSL 3 BASIC2.36□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.36□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC2.36□□□□□ -2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.3 ms