Protein–RNA interactions for Protein: Q2TAY7

SMU1, WD40 repeat-containing protein SMU1, humanhuman

Predictions only

Length 513 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMU1Q2TAY7 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SMU1Q2TAY7 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SMU1Q2TAY7 GPAT2-202ENST00000434632 3061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SMU1Q2TAY7 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SMU1Q2TAY7 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SMU1Q2TAY7 ABCA7-201ENST00000263094 6816 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SMU1Q2TAY7 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SMU1Q2TAY7 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
SMU1Q2TAY7 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SMU1Q2TAY7 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SMU1Q2TAY7 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
SMU1Q2TAY7 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SMU1Q2TAY7 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SMU1Q2TAY7 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SMU1Q2TAY7 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SMU1Q2TAY7 AL353803.2-201ENST00000436510 1846 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SMU1Q2TAY7 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SMU1Q2TAY7 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SMU1Q2TAY7 NWD2-201ENST00000309447 8325 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SMU1Q2TAY7 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SMU1Q2TAY7 NOTCH4-201ENST00000375023 6745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SMU1Q2TAY7 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SMU1Q2TAY7 AC004706.4-201ENST00000634965 3537 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SMU1Q2TAY7 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SMU1Q2TAY7 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SMU1Q2TAY7 AC244021.1-201ENST00000417218 3662 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SMU1Q2TAY7 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SMU1Q2TAY7 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SMU1Q2TAY7 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SMU1Q2TAY7 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SMU1Q2TAY7 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SMU1Q2TAY7 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SMU1Q2TAY7 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SMU1Q2TAY7 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SMU1Q2TAY7 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SMU1Q2TAY7 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
SMU1Q2TAY7 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SMU1Q2TAY7 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SMU1Q2TAY7 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
SMU1Q2TAY7 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
SMU1Q2TAY7 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
SMU1Q2TAY7 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SMU1Q2TAY7 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SMU1Q2TAY7 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SMU1Q2TAY7 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SMU1Q2TAY7 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SMU1Q2TAY7 AC138028.2-202ENST00000567968 4528 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SMU1Q2TAY7 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SMU1Q2TAY7 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SMU1Q2TAY7 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SMU1Q2TAY7 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SMU1Q2TAY7 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SMU1Q2TAY7 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SMU1Q2TAY7 SACM1L-201ENST00000389061 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SMU1Q2TAY7 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SMU1Q2TAY7 TAF6-205ENST00000437822 2318 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SMU1Q2TAY7 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SMU1Q2TAY7 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SMU1Q2TAY7 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SMU1Q2TAY7 UNC13B-201ENST00000378495 6303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SMU1Q2TAY7 TGIF2-202ENST00000373874 3432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SMU1Q2TAY7 FLI1-201ENST00000281428 4151 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SMU1Q2TAY7 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SMU1Q2TAY7 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SMU1Q2TAY7 AL669831.1-201ENST00000506640 6432 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SMU1Q2TAY7 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SMU1Q2TAY7 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SMU1Q2TAY7 GOLGA2-212ENST00000609374 2973 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SMU1Q2TAY7 HIPK3-201ENST00000303296 7408 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SMU1Q2TAY7 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SMU1Q2TAY7 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SMU1Q2TAY7 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SMU1Q2TAY7 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SMU1Q2TAY7 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SMU1Q2TAY7 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
SMU1Q2TAY7 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SMU1Q2TAY7 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SMU1Q2TAY7 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
SMU1Q2TAY7 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SMU1Q2TAY7 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SMU1Q2TAY7 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SMU1Q2TAY7 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SMU1Q2TAY7 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SMU1Q2TAY7 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SMU1Q2TAY7 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SMU1Q2TAY7 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SMU1Q2TAY7 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SMU1Q2TAY7 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SMU1Q2TAY7 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SMU1Q2TAY7 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SMU1Q2TAY7 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
SMU1Q2TAY7 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SMU1Q2TAY7 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SMU1Q2TAY7 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SMU1Q2TAY7 TMPRSS3-204ENST00000433957 2403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SMU1Q2TAY7 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SMU1Q2TAY7 PITPNM3-201ENST00000262483 7086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SMU1Q2TAY7 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SMU1Q2TAY7 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SMU1Q2TAY7 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.3 ms