Protein–RNA interactions for Protein: Q17RS7

GEN1, Flap endonuclease GEN homolog 1, humanhuman

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Length 908 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GEN1Q17RS7 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GEN1Q17RS7 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GEN1Q17RS7 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GEN1Q17RS7 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GEN1Q17RS7 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GEN1Q17RS7 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GEN1Q17RS7 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
GEN1Q17RS7 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GEN1Q17RS7 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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GEN1Q17RS7 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GEN1Q17RS7 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GEN1Q17RS7 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GEN1Q17RS7 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GEN1Q17RS7 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GEN1Q17RS7 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GEN1Q17RS7 SSTR2-201ENST00000357585 7683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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GEN1Q17RS7 KIF17-201ENST00000247986 3969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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GEN1Q17RS7 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GEN1Q17RS7 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GEN1Q17RS7 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GEN1Q17RS7 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GEN1Q17RS7 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GEN1Q17RS7 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GEN1Q17RS7 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
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GEN1Q17RS7 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
GEN1Q17RS7 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GEN1Q17RS7 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GEN1Q17RS7 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GEN1Q17RS7 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GEN1Q17RS7 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GEN1Q17RS7 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GEN1Q17RS7 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
GEN1Q17RS7 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GEN1Q17RS7 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
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GEN1Q17RS7 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
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GEN1Q17RS7 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
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GEN1Q17RS7 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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GEN1Q17RS7 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GEN1Q17RS7 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GEN1Q17RS7 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GEN1Q17RS7 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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GEN1Q17RS7 AC138969.2-201ENST00000532739 9932 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
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GEN1Q17RS7 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
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GEN1Q17RS7 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GEN1Q17RS7 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
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GEN1Q17RS7 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GEN1Q17RS7 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
GEN1Q17RS7 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GEN1Q17RS7 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
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GEN1Q17RS7 NAA38-206ENST00000576384 424 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GEN1Q17RS7 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GEN1Q17RS7 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GEN1Q17RS7 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GEN1Q17RS7 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GEN1Q17RS7 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GEN1Q17RS7 MAPKBP1-215ENST00000514566 5394 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GEN1Q17RS7 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GEN1Q17RS7 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GEN1Q17RS7 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GEN1Q17RS7 SMARCA4-214ENST00000589677 5181 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GEN1Q17RS7 ZFP90-209ENST00000570495 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GEN1Q17RS7 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GEN1Q17RS7 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GEN1Q17RS7 AC067750.1-201ENST00000608826 6545 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
GEN1Q17RS7 PTPRU-205ENST00000460170 5337 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GEN1Q17RS7 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GEN1Q17RS7 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
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