Protein–RNA interactions for Protein: Q16832

DDR2, Discoidin domain-containing receptor 2, humanhuman

Predictions only

Length 855 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDR2Q16832 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DDR2Q16832 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DDR2Q16832 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DDR2Q16832 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DDR2Q16832 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DDR2Q16832 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DDR2Q16832 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DDR2Q16832 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DDR2Q16832 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DDR2Q16832 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DDR2Q16832 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DDR2Q16832 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DDR2Q16832 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DDR2Q16832 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DDR2Q16832 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DDR2Q16832 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DDR2Q16832 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DDR2Q16832 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DDR2Q16832 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DDR2Q16832 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DDR2Q16832 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DDR2Q16832 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DDR2Q16832 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DDR2Q16832 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DDR2Q16832 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DDR2Q16832 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DDR2Q16832 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DDR2Q16832 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DDR2Q16832 TRMT112-201ENST00000308774 561 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DDR2Q16832 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
DDR2Q16832 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DDR2Q16832 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DDR2Q16832 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DDR2Q16832 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DDR2Q16832 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
DDR2Q16832 MIR1908-201ENST00000410394 80 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
DDR2Q16832 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DDR2Q16832 AC126768.2-201ENST00000511693 718 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DDR2Q16832 AC023310.1-201ENST00000554836 735 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
DDR2Q16832 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DDR2Q16832 AC010491.1-202ENST00000567048 528 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DDR2Q16832 AC120498.3-201ENST00000568884 542 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DDR2Q16832 KCNAB2-212ENST00000458166 1336 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DDR2Q16832 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
DDR2Q16832 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DDR2Q16832 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DDR2Q16832 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DDR2Q16832 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DDR2Q16832 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DDR2Q16832 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DDR2Q16832 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
DDR2Q16832 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DDR2Q16832 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DDR2Q16832 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DDR2Q16832 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DDR2Q16832 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DDR2Q16832 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DDR2Q16832 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DDR2Q16832 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DDR2Q16832 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DDR2Q16832 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DDR2Q16832 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DDR2Q16832 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DDR2Q16832 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DDR2Q16832 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DDR2Q16832 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DDR2Q16832 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DDR2Q16832 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DDR2Q16832 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DDR2Q16832 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
DDR2Q16832 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DDR2Q16832 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DDR2Q16832 SPDYE7P-201ENST00000355920 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DDR2Q16832 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DDR2Q16832 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DDR2Q16832 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
DDR2Q16832 ACTBP11-201ENST00000436287 1126 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
DDR2Q16832 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
DDR2Q16832 STARD4-205ENST00000505803 803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DDR2Q16832 STARD4-207ENST00000509887 1186 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DDR2Q16832 NME2-206ENST00000513177 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DDR2Q16832 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
DDR2Q16832 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DDR2Q16832 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DDR2Q16832 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DDR2Q16832 USB1-203ENST00000539737 1212 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DDR2Q16832 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DDR2Q16832 AL122035.1-201ENST00000556640 550 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DDR2Q16832 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
DDR2Q16832 ELOF1-208ENST00000591912 899 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DDR2Q16832 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
DDR2Q16832 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DDR2Q16832 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DDR2Q16832 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DDR2Q16832 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DDR2Q16832 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DDR2Q16832 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DDR2Q16832 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DDR2Q16832 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DDR2Q16832 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
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