Protein–RNA interactions for Protein: Q16720

ATP2B3, Plasma membrane calcium-transporting ATPase 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2B3Q16720 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ATP2B3Q16720 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ATP2B3Q16720 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ATP2B3Q16720 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ATP2B3Q16720 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ATP2B3Q16720 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ATP2B3Q16720 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ATP2B3Q16720 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ATP2B3Q16720 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ATP2B3Q16720 Z82214.2-201ENST00000420269 531 ntTSL 4 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ATP2B3Q16720 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ATP2B3Q16720 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ATP2B3Q16720 RCN1-210ENST00000532942 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ATP2B3Q16720 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ATP2B3Q16720 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ATP2B3Q16720 IFI27L1-210ENST00000556381 804 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ATP2B3Q16720 AC135178.3-201ENST00000583963 531 ntTSL 4 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ATP2B3Q16720 ANKS3-227ENST00000592711 580 ntTSL 4 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ATP2B3Q16720 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
ATP2B3Q16720 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
ATP2B3Q16720 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ATP2B3Q16720 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ATP2B3Q16720 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ATP2B3Q16720 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ATP2B3Q16720 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ATP2B3Q16720 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ATP2B3Q16720 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ATP2B3Q16720 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
ATP2B3Q16720 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ATP2B3Q16720 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ATP2B3Q16720 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ATP2B3Q16720 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ATP2B3Q16720 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ATP2B3Q16720 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ATP2B3Q16720 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ATP2B3Q16720 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ATP2B3Q16720 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ATP2B3Q16720 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ATP2B3Q16720 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ATP2B3Q16720 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ATP2B3Q16720 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ATP2B3Q16720 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ATP2B3Q16720 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ATP2B3Q16720 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ATP2B3Q16720 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ATP2B3Q16720 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ATP2B3Q16720 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ATP2B3Q16720 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ATP2B3Q16720 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ATP2B3Q16720 ZNF815P-202ENST00000422825 805 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ATP2B3Q16720 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
ATP2B3Q16720 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ATP2B3Q16720 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ATP2B3Q16720 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ATP2B3Q16720 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ATP2B3Q16720 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
ATP2B3Q16720 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ATP2B3Q16720 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ATP2B3Q16720 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ATP2B3Q16720 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ATP2B3Q16720 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ATP2B3Q16720 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ATP2B3Q16720 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ATP2B3Q16720 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ATP2B3Q16720 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ATP2B3Q16720 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ATP2B3Q16720 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ATP2B3Q16720 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
ATP2B3Q16720 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ATP2B3Q16720 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ATP2B3Q16720 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ATP2B3Q16720 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ATP2B3Q16720 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ATP2B3Q16720 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ATP2B3Q16720 RABEPK-206ENST00000628863 1537 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ATP2B3Q16720 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ATP2B3Q16720 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ATP2B3Q16720 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
ATP2B3Q16720 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ATP2B3Q16720 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ATP2B3Q16720 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ATP2B3Q16720 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ATP2B3Q16720 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ATP2B3Q16720 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ATP2B3Q16720 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
ATP2B3Q16720 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ATP2B3Q16720 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ATP2B3Q16720 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
ATP2B3Q16720 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
ATP2B3Q16720 GEMIN4-202ENST00000437269 1182 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ATP2B3Q16720 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ATP2B3Q16720 AC106772.2-201ENST00000515085 442 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ATP2B3Q16720 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ATP2B3Q16720 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ATP2B3Q16720 AL163974.1-201ENST00000554540 466 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ATP2B3Q16720 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ATP2B3Q16720 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ATP2B3Q16720 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ATP2B3Q16720 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ATP2B3Q16720 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
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