Protein–RNA interactions for Protein: Q16695

HIST3H3, Histone H3.1t, humanhuman

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Length 136 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIST3H3Q16695 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
HIST3H3Q16695 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
HIST3H3Q16695 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
HIST3H3Q16695 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
HIST3H3Q16695 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
HIST3H3Q16695 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
HIST3H3Q16695 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
HIST3H3Q16695 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
HIST3H3Q16695 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
HIST3H3Q16695 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
HIST3H3Q16695 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
HIST3H3Q16695 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
HIST3H3Q16695 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
HIST3H3Q16695 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
HIST3H3Q16695 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
HIST3H3Q16695 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
HIST3H3Q16695 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
HIST3H3Q16695 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
HIST3H3Q16695 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
HIST3H3Q16695 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
HIST3H3Q16695 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
HIST3H3Q16695 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
HIST3H3Q16695 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
HIST3H3Q16695 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
HIST3H3Q16695 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
HIST3H3Q16695 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
HIST3H3Q16695 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
HIST3H3Q16695 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
HIST3H3Q16695 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
HIST3H3Q16695 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
HIST3H3Q16695 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
HIST3H3Q16695 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
HIST3H3Q16695 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
HIST3H3Q16695 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
HIST3H3Q16695 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
HIST3H3Q16695 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
HIST3H3Q16695 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
HIST3H3Q16695 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
HIST3H3Q16695 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
HIST3H3Q16695 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
HIST3H3Q16695 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
HIST3H3Q16695 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
HIST3H3Q16695 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
HIST3H3Q16695 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
HIST3H3Q16695 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
HIST3H3Q16695 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
HIST3H3Q16695 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
HIST3H3Q16695 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
HIST3H3Q16695 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
HIST3H3Q16695 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
HIST3H3Q16695 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
HIST3H3Q16695 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
HIST3H3Q16695 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
HIST3H3Q16695 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
HIST3H3Q16695 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC13.51□□□□□ -0.25
HIST3H3Q16695 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
HIST3H3Q16695 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
HIST3H3Q16695 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
HIST3H3Q16695 ARHGEF5-201ENST00000056217 5544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
HIST3H3Q16695 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
HIST3H3Q16695 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
HIST3H3Q16695 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
HIST3H3Q16695 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
HIST3H3Q16695 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
HIST3H3Q16695 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
HIST3H3Q16695 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
HIST3H3Q16695 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
HIST3H3Q16695 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
HIST3H3Q16695 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
HIST3H3Q16695 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
HIST3H3Q16695 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
HIST3H3Q16695 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
HIST3H3Q16695 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
HIST3H3Q16695 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
HIST3H3Q16695 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
HIST3H3Q16695 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
HIST3H3Q16695 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
HIST3H3Q16695 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
HIST3H3Q16695 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
HIST3H3Q16695 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
HIST3H3Q16695 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
HIST3H3Q16695 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
HIST3H3Q16695 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
HIST3H3Q16695 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
HIST3H3Q16695 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
HIST3H3Q16695 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
HIST3H3Q16695 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
HIST3H3Q16695 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
HIST3H3Q16695 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
HIST3H3Q16695 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
HIST3H3Q16695 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
HIST3H3Q16695 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
HIST3H3Q16695 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
HIST3H3Q16695 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC13.5□□□□□ -0.25
HIST3H3Q16695 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
HIST3H3Q16695 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
HIST3H3Q16695 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
HIST3H3Q16695 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
HIST3H3Q16695 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
HIST3H3Q16695 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
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