Protein–RNA interactions for Protein: Q16568

CARTPT, Cocaine- and amphetamine-regulated transcript protein, humanhuman

Predictions only

Length 116 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARTPTQ16568 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
CARTPTQ16568 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
CARTPTQ16568 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
CARTPTQ16568 WASHC2A-203ENST00000351071 4642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
CARTPTQ16568 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
CARTPTQ16568 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
CARTPTQ16568 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
CARTPTQ16568 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
CARTPTQ16568 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
CARTPTQ16568 BAIAP3-202ENST00000397488 4583 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
CARTPTQ16568 FUT1-201ENST00000310160 4246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
CARTPTQ16568 Z99774.1-201ENST00000382641 2613 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
CARTPTQ16568 CIC-207ENST00000575354 5473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
CARTPTQ16568 PRICKLE1-201ENST00000345127 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
CARTPTQ16568 SLC23A1-201ENST00000348729 2299 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
CARTPTQ16568 CR383656.2-201ENST00000548656 2254 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
CARTPTQ16568 HIPK3-203ENST00000456517 7399 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
CARTPTQ16568 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
CARTPTQ16568 LIG1-203ENST00000536218 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
CARTPTQ16568 EHD1-202ENST00000359393 3618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
CARTPTQ16568 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
CARTPTQ16568 PLLP-205ENST00000613167 7578 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
CARTPTQ16568 CARHSP1-216ENST00000610831 2841 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
CARTPTQ16568 ARFGAP1-202ENST00000370275 3467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
CARTPTQ16568 ATG3-202ENST00000402314 3010 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
CARTPTQ16568 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
CARTPTQ16568 SLIT1-201ENST00000266058 7925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
CARTPTQ16568 ARHGAP27-203ENST00000428638 4242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
CARTPTQ16568 E2F6-201ENST00000307236 3317 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
CARTPTQ16568 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
CARTPTQ16568 AC004899.2-201ENST00000622993 3860 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
CARTPTQ16568 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
CARTPTQ16568 HBP1-212ENST00000485846 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
CARTPTQ16568 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
CARTPTQ16568 GTF2IRD1-202ENST00000424337 3077 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
CARTPTQ16568 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
CARTPTQ16568 LINC00475-202ENST00000416438 2506 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
CARTPTQ16568 TMEM231-207ENST00000568377 2920 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
CARTPTQ16568 UGT3A2-201ENST00000282507 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
CARTPTQ16568 THSD4-201ENST00000261862 3133 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
CARTPTQ16568 PLEKHN1-202ENST00000379409 2455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
CARTPTQ16568 PHYHIP-202ENST00000454243 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
CARTPTQ16568 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
CARTPTQ16568 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
CARTPTQ16568 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
CARTPTQ16568 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
CARTPTQ16568 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
CARTPTQ16568 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
CARTPTQ16568 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
CARTPTQ16568 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
CARTPTQ16568 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
CARTPTQ16568 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
CARTPTQ16568 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
CARTPTQ16568 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
CARTPTQ16568 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
CARTPTQ16568 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
CARTPTQ16568 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
CARTPTQ16568 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
CARTPTQ16568 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
CARTPTQ16568 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
CARTPTQ16568 MMAB-210ENST00000545712 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
CARTPTQ16568 HSPH1-202ENST00000380405 3480 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
CARTPTQ16568 WWC2-201ENST00000403733 8826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
CARTPTQ16568 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
CARTPTQ16568 AP4B1-201ENST00000256658 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
CARTPTQ16568 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
CARTPTQ16568 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
CARTPTQ16568 KIFC3-202ENST00000421376 3128 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
CARTPTQ16568 ZNF541-203ENST00000391901 4580 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
CARTPTQ16568 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
CARTPTQ16568 ARRB1-202ENST00000420843 3336 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
CARTPTQ16568 YTHDF3-216ENST00000623280 5193 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
CARTPTQ16568 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
CARTPTQ16568 PLIN4-201ENST00000301286 6353 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
CARTPTQ16568 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
CARTPTQ16568 FAM120A-202ENST00000375389 3585 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
CARTPTQ16568 PSD-202ENST00000406432 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
CARTPTQ16568 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
CARTPTQ16568 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
CARTPTQ16568 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
CARTPTQ16568 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
CARTPTQ16568 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
CARTPTQ16568 TRIM13-202ENST00000378182 7249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
CARTPTQ16568 REPS1-221ENST00000626459 3665 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
CARTPTQ16568 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
CARTPTQ16568 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
CARTPTQ16568 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
CARTPTQ16568 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
CARTPTQ16568 LINC00174-204ENST00000421767 4702 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
CARTPTQ16568 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
CARTPTQ16568 MAP3K21-202ENST00000366623 3910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
CARTPTQ16568 RILPL1-202ENST00000376874 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
CARTPTQ16568 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
CARTPTQ16568 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
CARTPTQ16568 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
CARTPTQ16568 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
CARTPTQ16568 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
CARTPTQ16568 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
CARTPTQ16568 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
CARTPTQ16568 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.8 ms