Protein–RNA interactions for Protein: Q16531

DDB1, DNA damage-binding protein 1, humanhuman

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Length 1,140 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDB1Q16531 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
DDB1Q16531 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
DDB1Q16531 SLC44A3-209ENST00000532427 1912 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
DDB1Q16531 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
DDB1Q16531 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
DDB1Q16531 RASSF3-202ENST00000336061 1030 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
DDB1Q16531 FMR1NB-201ENST00000370467 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
DDB1Q16531 AL583805.1-201ENST00000391389 531 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
DDB1Q16531 CD300A-204ENST00000392625 1163 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
DDB1Q16531 NUBP1-202ENST00000433392 1185 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
DDB1Q16531 AC108199.1-201ENST00000504249 508 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
DDB1Q16531 VDAC3-211ENST00000522572 799 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
DDB1Q16531 AC145207.3-201ENST00000576784 529 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
DDB1Q16531 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
DDB1Q16531 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
DDB1Q16531 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
DDB1Q16531 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
DDB1Q16531 LRP10-203ENST00000546834 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
DDB1Q16531 RAN-210ENST00000541630 1475 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
DDB1Q16531 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
DDB1Q16531 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
DDB1Q16531 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
DDB1Q16531 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
DDB1Q16531 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
DDB1Q16531 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
DDB1Q16531 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
DDB1Q16531 SGCE-204ENST00000428696 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
DDB1Q16531 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
DDB1Q16531 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
DDB1Q16531 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
DDB1Q16531 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
DDB1Q16531 SMTNL1-202ENST00000527972 1649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
DDB1Q16531 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
DDB1Q16531 TEX264-201ENST00000341333 1340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
DDB1Q16531 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.73
DDB1Q16531 NTF3-202ENST00000423158 1336 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
DDB1Q16531 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
DDB1Q16531 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
DDB1Q16531 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
DDB1Q16531 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
DDB1Q16531 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
DDB1Q16531 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
DDB1Q16531 SYCN-201ENST00000318438 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
DDB1Q16531 Z69890.1-201ENST00000382990 339 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
DDB1Q16531 AL627422.1-201ENST00000434104 580 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
DDB1Q16531 TNNT2-214ENST00000458432 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
DDB1Q16531 CHCHD2P9-201ENST00000461726 456 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
DDB1Q16531 NDUFS6P1-201ENST00000485187 316 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
DDB1Q16531 ANXA5-210ENST00000515017 1190 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
DDB1Q16531 ZNF586-204ENST00000598183 603 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
DDB1Q16531 FXYD6-FXYD2-202ENST00000614497 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
DDB1Q16531 PRSS45-202ENST00000620911 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
DDB1Q16531 LINC00969-257ENST00000625632 898 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
DDB1Q16531 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
DDB1Q16531 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
DDB1Q16531 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
DDB1Q16531 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
DDB1Q16531 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
DDB1Q16531 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
DDB1Q16531 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
DDB1Q16531 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
DDB1Q16531 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
DDB1Q16531 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
DDB1Q16531 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
DDB1Q16531 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
DDB1Q16531 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
DDB1Q16531 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
DDB1Q16531 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
DDB1Q16531 SLC25A20-202ENST00000430379 1576 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
DDB1Q16531 AC015909.3-201ENST00000572855 1794 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
DDB1Q16531 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
DDB1Q16531 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
DDB1Q16531 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
DDB1Q16531 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
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DDB1Q16531 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
DDB1Q16531 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
DDB1Q16531 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
DDB1Q16531 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
DDB1Q16531 CGB1-201ENST00000301407 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
DDB1Q16531 IGHV3-48-201ENST00000390624 432 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
DDB1Q16531 HLA-DQB2-232ENST00000437316 1214 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
DDB1Q16531 AC010234.1-201ENST00000494599 870 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
DDB1Q16531 MIR4522-201ENST00000584932 87 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
DDB1Q16531 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
DDB1Q16531 PIN1-207ENST00000588695 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
DDB1Q16531 PAX4-207ENST00000611453 1235 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
DDB1Q16531 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
DDB1Q16531 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
DDB1Q16531 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
DDB1Q16531 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
DDB1Q16531 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
DDB1Q16531 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
DDB1Q16531 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
DDB1Q16531 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
DDB1Q16531 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
DDB1Q16531 FAM168A-204ENST00000450446 1364 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
DDB1Q16531 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
DDB1Q16531 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
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