Protein–RNA interactions for Protein: Q16281

CNGA3, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-3, humanhuman

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Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA3Q16281 CUL7-203ENST00000535468 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CNGA3Q16281 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CNGA3Q16281 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CNGA3Q16281 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CNGA3Q16281 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CNGA3Q16281 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CNGA3Q16281 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CNGA3Q16281 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CNGA3Q16281 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CNGA3Q16281 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CNGA3Q16281 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CNGA3Q16281 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CNGA3Q16281 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CNGA3Q16281 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CNGA3Q16281 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CNGA3Q16281 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CNGA3Q16281 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CNGA3Q16281 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CNGA3Q16281 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CNGA3Q16281 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CNGA3Q16281 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CNGA3Q16281 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CNGA3Q16281 GDF11-201ENST00000257868 8657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CNGA3Q16281 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CNGA3Q16281 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CNGA3Q16281 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CNGA3Q16281 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CNGA3Q16281 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CNGA3Q16281 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CNGA3Q16281 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CNGA3Q16281 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CNGA3Q16281 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CNGA3Q16281 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CNGA3Q16281 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CNGA3Q16281 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CNGA3Q16281 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CNGA3Q16281 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CNGA3Q16281 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CNGA3Q16281 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CNGA3Q16281 IRAK1-203ENST00000369980 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CNGA3Q16281 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CNGA3Q16281 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CNGA3Q16281 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CNGA3Q16281 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CNGA3Q16281 PHAX-201ENST00000297540 4288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CNGA3Q16281 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CNGA3Q16281 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CNGA3Q16281 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CNGA3Q16281 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CNGA3Q16281 LMX1B-201ENST00000355497 5809 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CNGA3Q16281 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CNGA3Q16281 ENDOD1-201ENST00000278505 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CNGA3Q16281 NTRK2-201ENST00000277120 8633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CNGA3Q16281 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CNGA3Q16281 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CNGA3Q16281 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CNGA3Q16281 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CNGA3Q16281 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CNGA3Q16281 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CNGA3Q16281 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CNGA3Q16281 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CNGA3Q16281 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CNGA3Q16281 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CNGA3Q16281 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CNGA3Q16281 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CNGA3Q16281 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CNGA3Q16281 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CNGA3Q16281 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CNGA3Q16281 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CNGA3Q16281 ZNF516-201ENST00000443185 8118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CNGA3Q16281 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CNGA3Q16281 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CNGA3Q16281 PATZ1-203ENST00000351933 3638 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CNGA3Q16281 FADS2-201ENST00000257261 2964 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CNGA3Q16281 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CNGA3Q16281 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CNGA3Q16281 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CNGA3Q16281 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CNGA3Q16281 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CNGA3Q16281 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CNGA3Q16281 CCDC50-201ENST00000392455 8429 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CNGA3Q16281 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CNGA3Q16281 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CNGA3Q16281 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CNGA3Q16281 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CNGA3Q16281 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CNGA3Q16281 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CNGA3Q16281 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CNGA3Q16281 USP19-205ENST00000398898 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CNGA3Q16281 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CNGA3Q16281 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CNGA3Q16281 DNM1P51-202ENST00000558801 8752 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CNGA3Q16281 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CNGA3Q16281 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CNGA3Q16281 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CNGA3Q16281 LRRN1-201ENST00000319331 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CNGA3Q16281 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CNGA3Q16281 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CNGA3Q16281 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CNGA3Q16281 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
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