Protein–RNA interactions for Protein: Q15843

NEDD8, NEDD8, humanhuman

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Length 81 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8Q15843 AC020915.4-201ENST00000597230 2708 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.15
NEDD8Q15843 FRZB-201ENST00000295113 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
NEDD8Q15843 NFKB1-201ENST00000226574 4085 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
NEDD8Q15843 SPHK2-201ENST00000245222 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
NEDD8Q15843 PLXNB2-201ENST00000359337 6335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
NEDD8Q15843 STRA6-203ENST00000416286 2750 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
NEDD8Q15843 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
NEDD8Q15843 RNF216-202ENST00000389902 3293 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
NEDD8Q15843 HPCAL4-201ENST00000372844 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
NEDD8Q15843 PSMC1-201ENST00000261303 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
NEDD8Q15843 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
NEDD8Q15843 RAVER1-206ENST00000611074 3586 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
NEDD8Q15843 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
NEDD8Q15843 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC14.08□□□□□ -0.16
NEDD8Q15843 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
NEDD8Q15843 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
NEDD8Q15843 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC14.08□□□□□ -0.16
NEDD8Q15843 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
NEDD8Q15843 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
NEDD8Q15843 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
NEDD8Q15843 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC14.08□□□□□ -0.16
NEDD8Q15843 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
NEDD8Q15843 RFTN1-203ENST00000432519 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
NEDD8Q15843 RGS3-208ENST00000394646 2716 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
NEDD8Q15843 COL4A1-201ENST00000375820 6532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
NEDD8Q15843 SLC16A1-201ENST00000369626 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
NEDD8Q15843 GRM7-215ENST00000486284 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
NEDD8Q15843 IKZF1-205ENST00000357364 5925 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
NEDD8Q15843 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
NEDD8Q15843 SLC4A7-211ENST00000445684 4061 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
NEDD8Q15843 TPM3-206ENST00000330188 2108 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
NEDD8Q15843 PGLYRP4-202ENST00000368739 2116 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
NEDD8Q15843 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
NEDD8Q15843 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
NEDD8Q15843 AC083964.2-201ENST00000623988 2396 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
NEDD8Q15843 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
NEDD8Q15843 BTRC-203ENST00000393441 6084 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
NEDD8Q15843 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
NEDD8Q15843 ORMDL3-202ENST00000394169 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
NEDD8Q15843 IGHG3-202ENST00000641136 2751 ntAPPRIS P1 BASIC14.07□□□□□ -0.16
NEDD8Q15843 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
NEDD8Q15843 RAPGEF3-205ENST00000449771 6061 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
NEDD8Q15843 DBNDD1-203ENST00000392973 2689 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
NEDD8Q15843 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
NEDD8Q15843 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
NEDD8Q15843 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
NEDD8Q15843 VAC14-AS1-201ENST00000398177 2145 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
NEDD8Q15843 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
NEDD8Q15843 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
NEDD8Q15843 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
NEDD8Q15843 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
NEDD8Q15843 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
NEDD8Q15843 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
NEDD8Q15843 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
NEDD8Q15843 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
NEDD8Q15843 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
NEDD8Q15843 PLA2G15-209ENST00000566188 1203 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
NEDD8Q15843 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.07□□□□□ -0.16
NEDD8Q15843 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
NEDD8Q15843 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
NEDD8Q15843 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC14.07□□□□□ -0.16
NEDD8Q15843 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
NEDD8Q15843 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
NEDD8Q15843 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
NEDD8Q15843 FAM219A-201ENST00000297620 3588 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
NEDD8Q15843 GMCL1-201ENST00000282570 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
NEDD8Q15843 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
NEDD8Q15843 FZD6-206ENST00000523739 2774 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
NEDD8Q15843 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
NEDD8Q15843 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
NEDD8Q15843 DNAJB6-201ENST00000262177 2527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
NEDD8Q15843 DAZL-201ENST00000250863 3104 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
NEDD8Q15843 CD276-202ENST00000318443 3469 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
NEDD8Q15843 CCDC57-203ENST00000392343 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
NEDD8Q15843 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
NEDD8Q15843 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
NEDD8Q15843 JAKMIP3-201ENST00000298622 6626 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
NEDD8Q15843 CACNA1I-202ENST00000402142 10004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
NEDD8Q15843 RGS9-210ENST00000635833 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
NEDD8Q15843 MLXIPL-206ENST00000434326 3252 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
NEDD8Q15843 COL6A1-207ENST00000612273 3251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
NEDD8Q15843 PLTP-203ENST00000372431 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
NEDD8Q15843 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
NEDD8Q15843 RGS8-204ENST00000483095 1432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
NEDD8Q15843 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
NEDD8Q15843 NAA60-202ENST00000407558 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
NEDD8Q15843 PLIN4-201ENST00000301286 6353 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
NEDD8Q15843 CREB3L4-202ENST00000368600 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
NEDD8Q15843 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
NEDD8Q15843 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
NEDD8Q15843 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
NEDD8Q15843 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
NEDD8Q15843 SP6-202ENST00000536300 3848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
NEDD8Q15843 PDXK-210ENST00000468090 7297 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
NEDD8Q15843 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
NEDD8Q15843 SLC22A5-201ENST00000245407 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
NEDD8Q15843 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC14.06□□□□□ -0.16
NEDD8Q15843 STIM1-201ENST00000300737 4038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
NEDD8Q15843 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
NEDD8Q15843 CELF1-214ENST00000531165 3650 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
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