Protein–RNA interactions for Protein: Q15650

TRIP4, Activating signal cointegrator 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 581 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIP4Q15650 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRIP4Q15650 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRIP4Q15650 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRIP4Q15650 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRIP4Q15650 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRIP4Q15650 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRIP4Q15650 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRIP4Q15650 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRIP4Q15650 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRIP4Q15650 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRIP4Q15650 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRIP4Q15650 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRIP4Q15650 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRIP4Q15650 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRIP4Q15650 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRIP4Q15650 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRIP4Q15650 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRIP4Q15650 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRIP4Q15650 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRIP4Q15650 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRIP4Q15650 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRIP4Q15650 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRIP4Q15650 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
TRIP4Q15650 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRIP4Q15650 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRIP4Q15650 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRIP4Q15650 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRIP4Q15650 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRIP4Q15650 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRIP4Q15650 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRIP4Q15650 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRIP4Q15650 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRIP4Q15650 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRIP4Q15650 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRIP4Q15650 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
TRIP4Q15650 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRIP4Q15650 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
TRIP4Q15650 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRIP4Q15650 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
TRIP4Q15650 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRIP4Q15650 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
TRIP4Q15650 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRIP4Q15650 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRIP4Q15650 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRIP4Q15650 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRIP4Q15650 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRIP4Q15650 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRIP4Q15650 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRIP4Q15650 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
TRIP4Q15650 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRIP4Q15650 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRIP4Q15650 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRIP4Q15650 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRIP4Q15650 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRIP4Q15650 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRIP4Q15650 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRIP4Q15650 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRIP4Q15650 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRIP4Q15650 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRIP4Q15650 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRIP4Q15650 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRIP4Q15650 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRIP4Q15650 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIP4Q15650 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIP4Q15650 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIP4Q15650 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIP4Q15650 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIP4Q15650 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIP4Q15650 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIP4Q15650 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIP4Q15650 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIP4Q15650 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIP4Q15650 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIP4Q15650 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIP4Q15650 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIP4Q15650 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIP4Q15650 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIP4Q15650 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIP4Q15650 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIP4Q15650 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIP4Q15650 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIP4Q15650 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIP4Q15650 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIP4Q15650 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIP4Q15650 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIP4Q15650 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIP4Q15650 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIP4Q15650 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIP4Q15650 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIP4Q15650 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIP4Q15650 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIP4Q15650 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIP4Q15650 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIP4Q15650 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIP4Q15650 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIP4Q15650 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIP4Q15650 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIP4Q15650 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIP4Q15650 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIP4Q15650 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53 ms