Protein–RNA interactions for Protein: Q15649

ZNHIT3, Zinc finger HIT domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 155 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNHIT3Q15649 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
ZNHIT3Q15649 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
ZNHIT3Q15649 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
ZNHIT3Q15649 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
ZNHIT3Q15649 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
ZNHIT3Q15649 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
ZNHIT3Q15649 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
ZNHIT3Q15649 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
ZNHIT3Q15649 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
ZNHIT3Q15649 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
ZNHIT3Q15649 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
ZNHIT3Q15649 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
ZNHIT3Q15649 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC14.36□□□□□ -0.11
ZNHIT3Q15649 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
ZNHIT3Q15649 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC14.36□□□□□ -0.11
ZNHIT3Q15649 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
ZNHIT3Q15649 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
ZNHIT3Q15649 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
ZNHIT3Q15649 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
ZNHIT3Q15649 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
ZNHIT3Q15649 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
ZNHIT3Q15649 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
ZNHIT3Q15649 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
ZNHIT3Q15649 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
ZNHIT3Q15649 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
ZNHIT3Q15649 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
ZNHIT3Q15649 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
ZNHIT3Q15649 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
ZNHIT3Q15649 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
ZNHIT3Q15649 PCDHA11-201ENST00000398640 6115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
ZNHIT3Q15649 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
ZNHIT3Q15649 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
ZNHIT3Q15649 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
ZNHIT3Q15649 KDR-201ENST00000263923 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
ZNHIT3Q15649 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
ZNHIT3Q15649 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
ZNHIT3Q15649 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
ZNHIT3Q15649 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
ZNHIT3Q15649 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
ZNHIT3Q15649 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
ZNHIT3Q15649 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
ZNHIT3Q15649 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
ZNHIT3Q15649 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
ZNHIT3Q15649 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
ZNHIT3Q15649 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
ZNHIT3Q15649 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
ZNHIT3Q15649 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
ZNHIT3Q15649 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
ZNHIT3Q15649 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
ZNHIT3Q15649 PRDM16-203ENST00000378391 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
ZNHIT3Q15649 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
ZNHIT3Q15649 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
ZNHIT3Q15649 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
ZNHIT3Q15649 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
ZNHIT3Q15649 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
ZNHIT3Q15649 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
ZNHIT3Q15649 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
ZNHIT3Q15649 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
ZNHIT3Q15649 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
ZNHIT3Q15649 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
ZNHIT3Q15649 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
ZNHIT3Q15649 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
ZNHIT3Q15649 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
ZNHIT3Q15649 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
ZNHIT3Q15649 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC14.35□□□□□ -0.11
ZNHIT3Q15649 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC14.35□□□□□ -0.11
ZNHIT3Q15649 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
ZNHIT3Q15649 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC14.35□□□□□ -0.11
ZNHIT3Q15649 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
ZNHIT3Q15649 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
ZNHIT3Q15649 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
ZNHIT3Q15649 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
ZNHIT3Q15649 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
ZNHIT3Q15649 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
ZNHIT3Q15649 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
ZNHIT3Q15649 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
ZNHIT3Q15649 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
ZNHIT3Q15649 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
ZNHIT3Q15649 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
ZNHIT3Q15649 MN1-201ENST00000302326 7556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
ZNHIT3Q15649 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
ZNHIT3Q15649 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
ZNHIT3Q15649 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
ZNHIT3Q15649 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
ZNHIT3Q15649 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
ZNHIT3Q15649 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
ZNHIT3Q15649 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
ZNHIT3Q15649 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
ZNHIT3Q15649 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
ZNHIT3Q15649 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
ZNHIT3Q15649 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
ZNHIT3Q15649 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
ZNHIT3Q15649 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
ZNHIT3Q15649 NFATC3-203ENST00000349223 6328 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
ZNHIT3Q15649 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
ZNHIT3Q15649 CDK5RAP2-202ENST00000360190 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
ZNHIT3Q15649 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
ZNHIT3Q15649 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
ZNHIT3Q15649 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
ZNHIT3Q15649 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.9 ms