Protein–RNA interactions for Protein: Q15075

EEA1, Early endosome antigen 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,411 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EEA1Q15075 NPPA-201ENST00000376476 728 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
EEA1Q15075 TXNRD3NB-202ENST00000383572 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
EEA1Q15075 REEP1-202ENST00000453231 940 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
EEA1Q15075 AC100827.2-201ENST00000563214 1194 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
EEA1Q15075 RPS5-209ENST00000601521 1203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
EEA1Q15075 AL606495.2-201ENST00000605867 535 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
EEA1Q15075 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
EEA1Q15075 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
EEA1Q15075 AL008718.2-201ENST00000609206 1313 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
EEA1Q15075 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
EEA1Q15075 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
EEA1Q15075 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
EEA1Q15075 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
EEA1Q15075 ALAS2-202ENST00000335854 1795 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
EEA1Q15075 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
EEA1Q15075 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
EEA1Q15075 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
EEA1Q15075 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
EEA1Q15075 TMEM9-204ENST00000367334 1529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
EEA1Q15075 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
EEA1Q15075 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
EEA1Q15075 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
EEA1Q15075 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
EEA1Q15075 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
EEA1Q15075 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
EEA1Q15075 C1orf159-201ENST00000379319 1097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
EEA1Q15075 MEMO1-204ENST00000407893 682 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
EEA1Q15075 HLA-J-204ENST00000495278 958 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
EEA1Q15075 AC105362.1-201ENST00000511234 564 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
EEA1Q15075 AC104241.2-201ENST00000532748 789 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
EEA1Q15075 AURKB-202ENST00000534871 1167 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
EEA1Q15075 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
EEA1Q15075 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC24.49■■□□□ 1.51
EEA1Q15075 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
EEA1Q15075 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
EEA1Q15075 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
EEA1Q15075 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
EEA1Q15075 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
EEA1Q15075 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
EEA1Q15075 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
EEA1Q15075 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
EEA1Q15075 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
EEA1Q15075 KAAG1-201ENST00000274766 1382 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
EEA1Q15075 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
EEA1Q15075 AC004899.1-201ENST00000424687 1714 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
EEA1Q15075 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
EEA1Q15075 HIST1H2AD-201ENST00000341023 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
EEA1Q15075 CSHL1-203ENST00000346606 659 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
EEA1Q15075 DEF8-202ENST00000418391 852 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
EEA1Q15075 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
EEA1Q15075 KLF2P1-201ENST00000447438 1042 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
EEA1Q15075 ACTG1P17-201ENST00000558391 1119 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
EEA1Q15075 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC24.48■■□□□ 1.51
EEA1Q15075 LGALS3BP-202ENST00000585407 936 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
EEA1Q15075 MIR6720-201ENST00000611664 98 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
EEA1Q15075 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
EEA1Q15075 CASP6-202ENST00000352981 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
EEA1Q15075 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
EEA1Q15075 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
EEA1Q15075 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
EEA1Q15075 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
EEA1Q15075 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
EEA1Q15075 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
EEA1Q15075 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
EEA1Q15075 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
EEA1Q15075 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
EEA1Q15075 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
EEA1Q15075 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
EEA1Q15075 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
EEA1Q15075 MBD3L5-201ENST00000329753 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
EEA1Q15075 C1orf53-201ENST00000367393 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
EEA1Q15075 CTNNBIP1-202ENST00000377258 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
EEA1Q15075 ETV2-201ENST00000379023 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
EEA1Q15075 NRSN2-201ENST00000382285 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
EEA1Q15075 LINC00278-201ENST00000425031 528 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
EEA1Q15075 SKA2-202ENST00000437036 625 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
EEA1Q15075 AC012441.2-201ENST00000444843 739 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
EEA1Q15075 IGHV4-4-201ENST00000455737 417 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
EEA1Q15075 LAMA5-AS1-203ENST00000478167 690 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
EEA1Q15075 AC022903.1-201ENST00000579327 469 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
EEA1Q15075 NDUFV2P1-201ENST00000596415 907 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
EEA1Q15075 LINC01669-205ENST00000624561 713 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
EEA1Q15075 AL358215.2-201ENST00000639693 946 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
EEA1Q15075 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
EEA1Q15075 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
EEA1Q15075 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
EEA1Q15075 AMT-239ENST00000636865 1914 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
EEA1Q15075 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
EEA1Q15075 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
EEA1Q15075 ID2-203ENST00000396290 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
EEA1Q15075 KRT8P28-201ENST00000433288 1390 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
EEA1Q15075 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
EEA1Q15075 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
EEA1Q15075 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
EEA1Q15075 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
EEA1Q15075 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
EEA1Q15075 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
EEA1Q15075 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
EEA1Q15075 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
EEA1Q15075 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
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