Protein–RNA interactions for Protein: Q14993

COL19A1, Collagen alpha-1(XIX) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,142 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL19A1Q14993 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
COL19A1Q14993 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
COL19A1Q14993 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
COL19A1Q14993 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
COL19A1Q14993 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
COL19A1Q14993 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
COL19A1Q14993 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
COL19A1Q14993 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
COL19A1Q14993 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
COL19A1Q14993 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
COL19A1Q14993 CGB1-201ENST00000301407 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
COL19A1Q14993 BAK1P1-201ENST00000317045 636 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
COL19A1Q14993 CRIP3-202ENST00000372569 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
COL19A1Q14993 AL583805.1-201ENST00000391389 531 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
COL19A1Q14993 BANF1P3-201ENST00000412556 261 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
COL19A1Q14993 AC006455.8-201ENST00000451381 351 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
COL19A1Q14993 NCK1-AS1-203ENST00000474250 827 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
COL19A1Q14993 RN7SL81P-201ENST00000493781 261 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
COL19A1Q14993 LINC02417-201ENST00000542449 515 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
COL19A1Q14993 AC145207.8-201ENST00000580897 563 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
COL19A1Q14993 AC087392.5-201ENST00000612517 489 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
COL19A1Q14993 MUC1-226ENST00000614519 1093 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
COL19A1Q14993 RPS10-207ENST00000621356 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
COL19A1Q14993 AC104333.4-201ENST00000632866 554 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
COL19A1Q14993 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
COL19A1Q14993 AC144522.1-201ENST00000625111 1658 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
COL19A1Q14993 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
COL19A1Q14993 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
COL19A1Q14993 AC090502.4-201ENST00000551714 1386 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
COL19A1Q14993 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
COL19A1Q14993 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
COL19A1Q14993 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
COL19A1Q14993 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.09
COL19A1Q14993 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
COL19A1Q14993 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
COL19A1Q14993 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
COL19A1Q14993 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
COL19A1Q14993 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
COL19A1Q14993 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
COL19A1Q14993 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
COL19A1Q14993 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
COL19A1Q14993 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
COL19A1Q14993 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
COL19A1Q14993 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
COL19A1Q14993 C8G-201ENST00000224181 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
COL19A1Q14993 GSTP1-201ENST00000398603 700 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
COL19A1Q14993 LAMA4-208ENST00000431543 1080 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
COL19A1Q14993 PSMD4P1-201ENST00000433951 1109 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
COL19A1Q14993 AL645933.1-201ENST00000440087 609 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
COL19A1Q14993 ALG1L13P-202ENST00000519320 584 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
COL19A1Q14993 PPFIBP1-204ENST00000535047 875 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
COL19A1Q14993 NDUFC1-209ENST00000539002 1198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
COL19A1Q14993 NDUFC1-211ENST00000544855 1257 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
COL19A1Q14993 DCTPP1-202ENST00000565758 749 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
COL19A1Q14993 AC040162.4-201ENST00000574912 1185 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
COL19A1Q14993 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
COL19A1Q14993 ZNF790-AS1-203ENST00000588906 850 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
COL19A1Q14993 AP001527.2-201ENST00000614441 631 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
COL19A1Q14993 AC244250.3-201ENST00000620749 366 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
COL19A1Q14993 AC138466.4-201ENST00000623965 852 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
COL19A1Q14993 AC073911.3-201ENST00000624401 631 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
COL19A1Q14993 GLUD1P2-203ENST00000631118 486 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
COL19A1Q14993 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
COL19A1Q14993 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
COL19A1Q14993 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
COL19A1Q14993 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
COL19A1Q14993 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
COL19A1Q14993 PCNA-202ENST00000379160 1359 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
COL19A1Q14993 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
COL19A1Q14993 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
COL19A1Q14993 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
COL19A1Q14993 ENO3-202ENST00000518175 1448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
COL19A1Q14993 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
COL19A1Q14993 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
COL19A1Q14993 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
COL19A1Q14993 CYP4F23P-201ENST00000593402 1579 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
COL19A1Q14993 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
COL19A1Q14993 CEP128-201ENST00000216517 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
COL19A1Q14993 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
COL19A1Q14993 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
COL19A1Q14993 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
COL19A1Q14993 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
COL19A1Q14993 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
COL19A1Q14993 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
COL19A1Q14993 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
COL19A1Q14993 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
COL19A1Q14993 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
COL19A1Q14993 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
COL19A1Q14993 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
COL19A1Q14993 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
COL19A1Q14993 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
COL19A1Q14993 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
COL19A1Q14993 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
COL19A1Q14993 MBP-201ENST00000354542 575 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
COL19A1Q14993 TMEM242-201ENST00000367144 1030 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
COL19A1Q14993 CCDC167-201ENST00000373408 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
COL19A1Q14993 NRSN2-201ENST00000382285 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
COL19A1Q14993 AC012442.2-201ENST00000414784 425 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
COL19A1Q14993 IFI35-203ENST00000415816 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
COL19A1Q14993 PSMA1-202ENST00000418988 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms