Protein–RNA interactions for Protein: Q14839

CHD4, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 4, humanhuman

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Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD4Q14839 EXOSC5-204ENST00000596905 826 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CHD4Q14839 PTOV1-AS2-203ENST00000601893 719 ntTSL 4 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CHD4Q14839 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CHD4Q14839 IL9RP3-201ENST00000442856 1674 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
CHD4Q14839 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CHD4Q14839 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CHD4Q14839 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CHD4Q14839 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CHD4Q14839 SERPING1-204ENST00000378324 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CHD4Q14839 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CHD4Q14839 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CHD4Q14839 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CHD4Q14839 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CHD4Q14839 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CHD4Q14839 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CHD4Q14839 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CHD4Q14839 KRTAP10-3-201ENST00000391620 971 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CHD4Q14839 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
CHD4Q14839 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
CHD4Q14839 LINC01875-201ENST00000454477 660 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CHD4Q14839 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CHD4Q14839 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CHD4Q14839 PMEL-214ENST00000550447 901 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CHD4Q14839 AC007656.1-201ENST00000552238 573 ntTSL 4 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CHD4Q14839 ALKBH7-202ENST00000596657 603 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CHD4Q14839 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CHD4Q14839 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
CHD4Q14839 FAM90A7P-201ENST00000382628 1395 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
CHD4Q14839 FAM90A23P-201ENST00000400136 1395 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
CHD4Q14839 FAM90A21P-201ENST00000510875 1396 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
CHD4Q14839 FAM90A15P-201ENST00000514465 1395 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
CHD4Q14839 FAM90A6P-201ENST00000515148 1394 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
CHD4Q14839 FAM90A16P-201ENST00000526662 1395 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
CHD4Q14839 FAM90A9P-201ENST00000527940 1395 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
CHD4Q14839 FAM90A5P-201ENST00000528738 1395 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
CHD4Q14839 FAM90A14P-201ENST00000530386 1395 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
CHD4Q14839 FAM90A13P-201ENST00000534703 1395 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
CHD4Q14839 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CHD4Q14839 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CHD4Q14839 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CHD4Q14839 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CHD4Q14839 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CHD4Q14839 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
CHD4Q14839 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CHD4Q14839 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CHD4Q14839 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CHD4Q14839 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CHD4Q14839 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CHD4Q14839 FMR1NB-201ENST00000370467 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CHD4Q14839 AC156455.1-203ENST00000423999 893 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CHD4Q14839 C17orf58-202ENST00000449250 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CHD4Q14839 TIMM17B-204ENST00000465150 964 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CHD4Q14839 AC008723.1-201ENST00000506922 207 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
CHD4Q14839 MEG3_2.1-201ENST00000611456 105 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
CHD4Q14839 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CHD4Q14839 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CHD4Q14839 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CHD4Q14839 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CHD4Q14839 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CHD4Q14839 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CHD4Q14839 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
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CHD4Q14839 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CHD4Q14839 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CHD4Q14839 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
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CHD4Q14839 CD74-202ENST00000353334 1449 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
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CHD4Q14839 LINC02021-201ENST00000504808 1608 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CHD4Q14839 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CHD4Q14839 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CHD4Q14839 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CHD4Q14839 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CHD4Q14839 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CHD4Q14839 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CHD4Q14839 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CHD4Q14839 CRYBB1-201ENST00000215939 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CHD4Q14839 AC114812.1-201ENST00000421868 689 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CHD4Q14839 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CHD4Q14839 S100A2-205ENST00000487430 752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CHD4Q14839 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CHD4Q14839 SDHAF2-206ENST00000542074 835 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CHD4Q14839 ZNF350-AS1-202ENST00000600253 577 ntTSL 4 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CHD4Q14839 TP53-221ENST00000615910 1149 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CHD4Q14839 AQP7-213ENST00000624075 1270 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CHD4Q14839 CSAG3-203ENST00000638835 793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CHD4Q14839 CSAG2-204ENST00000640702 793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CHD4Q14839 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CHD4Q14839 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CHD4Q14839 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CHD4Q14839 SLC50A1-203ENST00000368404 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CHD4Q14839 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CHD4Q14839 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CHD4Q14839 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CHD4Q14839 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CHD4Q14839 NIT1-203ENST00000368009 1362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CHD4Q14839 OSCP1-204ENST00000433045 1381 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CHD4Q14839 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CHD4Q14839 CGB1-201ENST00000301407 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
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