Protein–RNA interactions for Protein: Q14699

RFTN1, Raftlin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 578 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFTN1Q14699 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
RFTN1Q14699 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
RFTN1Q14699 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
RFTN1Q14699 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
RFTN1Q14699 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RFTN1Q14699 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RFTN1Q14699 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RFTN1Q14699 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RFTN1Q14699 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RFTN1Q14699 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RFTN1Q14699 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RFTN1Q14699 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RFTN1Q14699 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RFTN1Q14699 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RFTN1Q14699 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
RFTN1Q14699 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RFTN1Q14699 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RFTN1Q14699 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
RFTN1Q14699 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RFTN1Q14699 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
RFTN1Q14699 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RFTN1Q14699 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RFTN1Q14699 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RFTN1Q14699 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RFTN1Q14699 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RFTN1Q14699 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RFTN1Q14699 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
RFTN1Q14699 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
RFTN1Q14699 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RFTN1Q14699 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RFTN1Q14699 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RFTN1Q14699 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
RFTN1Q14699 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RFTN1Q14699 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
RFTN1Q14699 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RFTN1Q14699 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RFTN1Q14699 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RFTN1Q14699 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RFTN1Q14699 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RFTN1Q14699 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RFTN1Q14699 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RFTN1Q14699 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RFTN1Q14699 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RFTN1Q14699 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RFTN1Q14699 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RFTN1Q14699 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RFTN1Q14699 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RFTN1Q14699 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RFTN1Q14699 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RFTN1Q14699 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RFTN1Q14699 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RFTN1Q14699 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RFTN1Q14699 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RFTN1Q14699 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RFTN1Q14699 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RFTN1Q14699 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RFTN1Q14699 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RFTN1Q14699 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RFTN1Q14699 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RFTN1Q14699 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RFTN1Q14699 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RFTN1Q14699 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RFTN1Q14699 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RFTN1Q14699 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RFTN1Q14699 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RFTN1Q14699 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RFTN1Q14699 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RFTN1Q14699 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RFTN1Q14699 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RFTN1Q14699 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RFTN1Q14699 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RFTN1Q14699 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RFTN1Q14699 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RFTN1Q14699 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RFTN1Q14699 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RFTN1Q14699 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RFTN1Q14699 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RFTN1Q14699 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
RFTN1Q14699 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RFTN1Q14699 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RFTN1Q14699 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
RFTN1Q14699 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RFTN1Q14699 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RFTN1Q14699 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RFTN1Q14699 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RFTN1Q14699 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
RFTN1Q14699 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RFTN1Q14699 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RFTN1Q14699 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RFTN1Q14699 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RFTN1Q14699 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RFTN1Q14699 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RFTN1Q14699 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
RFTN1Q14699 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RFTN1Q14699 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RFTN1Q14699 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RFTN1Q14699 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RFTN1Q14699 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RFTN1Q14699 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RFTN1Q14699 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
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