Protein–RNA interactions for Protein: Q14563

SEMA3A, Semaphorin-3A, humanhuman

Predictions only

Length 771 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3AQ14563 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SEMA3AQ14563 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SEMA3AQ14563 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
SEMA3AQ14563 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SEMA3AQ14563 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SEMA3AQ14563 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SEMA3AQ14563 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SEMA3AQ14563 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SEMA3AQ14563 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SEMA3AQ14563 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SEMA3AQ14563 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SEMA3AQ14563 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SEMA3AQ14563 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SEMA3AQ14563 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SEMA3AQ14563 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SEMA3AQ14563 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SEMA3AQ14563 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SEMA3AQ14563 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SEMA3AQ14563 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SEMA3AQ14563 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SEMA3AQ14563 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SEMA3AQ14563 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SEMA3AQ14563 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SEMA3AQ14563 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SEMA3AQ14563 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SEMA3AQ14563 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SEMA3AQ14563 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SEMA3AQ14563 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SEMA3AQ14563 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SEMA3AQ14563 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SEMA3AQ14563 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SEMA3AQ14563 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SEMA3AQ14563 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SEMA3AQ14563 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SEMA3AQ14563 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
SEMA3AQ14563 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SEMA3AQ14563 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SEMA3AQ14563 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SEMA3AQ14563 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SEMA3AQ14563 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SEMA3AQ14563 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SEMA3AQ14563 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
SEMA3AQ14563 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SEMA3AQ14563 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SEMA3AQ14563 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SEMA3AQ14563 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SEMA3AQ14563 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
SEMA3AQ14563 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SEMA3AQ14563 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
SEMA3AQ14563 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SEMA3AQ14563 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SEMA3AQ14563 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SEMA3AQ14563 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SEMA3AQ14563 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SEMA3AQ14563 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SEMA3AQ14563 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SEMA3AQ14563 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SEMA3AQ14563 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SEMA3AQ14563 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SEMA3AQ14563 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SEMA3AQ14563 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SEMA3AQ14563 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SEMA3AQ14563 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SEMA3AQ14563 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SEMA3AQ14563 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SEMA3AQ14563 PAK6-202ENST00000455577 4215 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SEMA3AQ14563 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SEMA3AQ14563 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SEMA3AQ14563 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SEMA3AQ14563 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SEMA3AQ14563 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
SEMA3AQ14563 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SEMA3AQ14563 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SEMA3AQ14563 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SEMA3AQ14563 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
SEMA3AQ14563 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SEMA3AQ14563 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SEMA3AQ14563 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SEMA3AQ14563 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SEMA3AQ14563 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SEMA3AQ14563 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SEMA3AQ14563 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SEMA3AQ14563 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SEMA3AQ14563 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SEMA3AQ14563 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SEMA3AQ14563 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SEMA3AQ14563 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
SEMA3AQ14563 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SEMA3AQ14563 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
SEMA3AQ14563 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SEMA3AQ14563 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SEMA3AQ14563 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
SEMA3AQ14563 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SEMA3AQ14563 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SEMA3AQ14563 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SEMA3AQ14563 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SEMA3AQ14563 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
SEMA3AQ14563 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SEMA3AQ14563 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SEMA3AQ14563 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
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