Protein–RNA interactions for Protein: Q14162

SCARF1, Scavenger receptor class F member 1, humanhuman

Predictions only

Length 830 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARF1Q14162 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
SCARF1Q14162 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SCARF1Q14162 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SCARF1Q14162 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SCARF1Q14162 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SCARF1Q14162 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SCARF1Q14162 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SCARF1Q14162 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SCARF1Q14162 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SCARF1Q14162 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SCARF1Q14162 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SCARF1Q14162 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SCARF1Q14162 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SCARF1Q14162 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SCARF1Q14162 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SCARF1Q14162 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SCARF1Q14162 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SCARF1Q14162 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SCARF1Q14162 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SCARF1Q14162 CIDEC-201ENST00000336832 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SCARF1Q14162 CSAG1-202ENST00000370287 875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SCARF1Q14162 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SCARF1Q14162 GGCT-203ENST00000409144 836 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SCARF1Q14162 AC012506.3-201ENST00000415245 892 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SCARF1Q14162 CIDEC-203ENST00000423850 1036 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SCARF1Q14162 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SCARF1Q14162 POM121L10P-201ENST00000436994 1285 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
SCARF1Q14162 CNN2P10-201ENST00000443067 918 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
SCARF1Q14162 CIDEC-206ENST00000455015 1123 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SCARF1Q14162 GDNF-AS1-201ENST00000503382 604 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SCARF1Q14162 ANAPC13-205ENST00000511751 896 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SCARF1Q14162 AC100858.3-202ENST00000533496 553 ntTSL 4 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SCARF1Q14162 GGCT-201ENST00000005374 1032 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SCARF1Q14162 CHMP4BP1-201ENST00000556017 588 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
SCARF1Q14162 NIP7-208ENST00000569637 1099 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SCARF1Q14162 MIR3619-201ENST00000579667 83 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
SCARF1Q14162 NKG7-204ENST00000595217 816 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SCARF1Q14162 AC011495.3-201ENST00000596472 427 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SCARF1Q14162 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SCARF1Q14162 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SCARF1Q14162 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SCARF1Q14162 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SCARF1Q14162 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SCARF1Q14162 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SCARF1Q14162 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SCARF1Q14162 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SCARF1Q14162 ZNF815P-201ENST00000421890 1352 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SCARF1Q14162 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SCARF1Q14162 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SCARF1Q14162 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SCARF1Q14162 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SCARF1Q14162 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SCARF1Q14162 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SCARF1Q14162 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
SCARF1Q14162 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SCARF1Q14162 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SCARF1Q14162 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SCARF1Q14162 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SCARF1Q14162 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SCARF1Q14162 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SCARF1Q14162 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SCARF1Q14162 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SCARF1Q14162 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SCARF1Q14162 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SCARF1Q14162 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SCARF1Q14162 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
SCARF1Q14162 SLC25A26-201ENST00000336733 1023 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SCARF1Q14162 ANAPC11-202ENST00000357385 881 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SCARF1Q14162 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SCARF1Q14162 PSTK-202ENST00000405485 1047 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SCARF1Q14162 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SCARF1Q14162 BX324167.1-201ENST00000451118 805 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SCARF1Q14162 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SCARF1Q14162 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SCARF1Q14162 TNNT1-203ENST00000536926 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SCARF1Q14162 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SCARF1Q14162 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SCARF1Q14162 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SCARF1Q14162 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SCARF1Q14162 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
SCARF1Q14162 LINC00595-217ENST00000635545 549 ntTSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SCARF1Q14162 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SCARF1Q14162 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SCARF1Q14162 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SCARF1Q14162 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SCARF1Q14162 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
SCARF1Q14162 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SCARF1Q14162 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SCARF1Q14162 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SCARF1Q14162 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
SCARF1Q14162 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SCARF1Q14162 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SCARF1Q14162 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SCARF1Q14162 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SCARF1Q14162 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SCARF1Q14162 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SCARF1Q14162 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SCARF1Q14162 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SCARF1Q14162 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SCARF1Q14162 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.6 ms