Protein–RNA interactions for Protein: Q14050

COL9A3, Collagen alpha-3(IX) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 684 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL9A3Q14050 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
COL9A3Q14050 SLC26A11-201ENST00000361193 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
COL9A3Q14050 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
COL9A3Q14050 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
COL9A3Q14050 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
COL9A3Q14050 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
COL9A3Q14050 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
COL9A3Q14050 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
COL9A3Q14050 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
COL9A3Q14050 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
COL9A3Q14050 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
COL9A3Q14050 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
COL9A3Q14050 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
COL9A3Q14050 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
COL9A3Q14050 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
COL9A3Q14050 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
COL9A3Q14050 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC17.94■□□□□ 0.46
COL9A3Q14050 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
COL9A3Q14050 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
COL9A3Q14050 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
COL9A3Q14050 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
COL9A3Q14050 XRCC3-211ENST00000555055 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
COL9A3Q14050 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
COL9A3Q14050 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
COL9A3Q14050 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
COL9A3Q14050 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
COL9A3Q14050 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
COL9A3Q14050 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
COL9A3Q14050 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
COL9A3Q14050 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
COL9A3Q14050 MSTO1-202ENST00000368341 2245 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
COL9A3Q14050 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
COL9A3Q14050 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
COL9A3Q14050 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
COL9A3Q14050 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
COL9A3Q14050 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
COL9A3Q14050 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
COL9A3Q14050 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
COL9A3Q14050 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
COL9A3Q14050 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
COL9A3Q14050 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
COL9A3Q14050 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
COL9A3Q14050 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
COL9A3Q14050 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
COL9A3Q14050 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
COL9A3Q14050 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
COL9A3Q14050 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
COL9A3Q14050 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
COL9A3Q14050 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
COL9A3Q14050 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
COL9A3Q14050 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
COL9A3Q14050 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
COL9A3Q14050 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
COL9A3Q14050 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
COL9A3Q14050 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
COL9A3Q14050 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
COL9A3Q14050 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
COL9A3Q14050 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
COL9A3Q14050 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
COL9A3Q14050 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
COL9A3Q14050 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
COL9A3Q14050 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
COL9A3Q14050 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
COL9A3Q14050 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
COL9A3Q14050 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
COL9A3Q14050 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
COL9A3Q14050 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
COL9A3Q14050 LINC01285-201ENST00000412422 2289 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
COL9A3Q14050 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
COL9A3Q14050 GPAT3-201ENST00000264409 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
COL9A3Q14050 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
COL9A3Q14050 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
COL9A3Q14050 CDCA7-202ENST00000347703 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
COL9A3Q14050 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
COL9A3Q14050 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
COL9A3Q14050 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
COL9A3Q14050 KCTD10-208ENST00000540089 3096 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
COL9A3Q14050 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
COL9A3Q14050 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
COL9A3Q14050 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
COL9A3Q14050 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
COL9A3Q14050 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
COL9A3Q14050 ZC3HAV1-204ENST00000471652 3182 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
COL9A3Q14050 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
COL9A3Q14050 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
COL9A3Q14050 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
COL9A3Q14050 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
COL9A3Q14050 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
COL9A3Q14050 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
COL9A3Q14050 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
COL9A3Q14050 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
COL9A3Q14050 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
COL9A3Q14050 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
COL9A3Q14050 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
COL9A3Q14050 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC17.92■□□□□ 0.46
COL9A3Q14050 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
COL9A3Q14050 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
COL9A3Q14050 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
COL9A3Q14050 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
COL9A3Q14050 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
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