Protein–RNA interactions for Protein: Q13635

PTCH1, Protein patched homolog 1, humanhuman

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Length 1,447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTCH1Q13635 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PTCH1Q13635 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PTCH1Q13635 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PTCH1Q13635 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PTCH1Q13635 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PTCH1Q13635 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PTCH1Q13635 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PTCH1Q13635 ENO3-202ENST00000518175 1448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PTCH1Q13635 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PTCH1Q13635 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PTCH1Q13635 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PTCH1Q13635 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
PTCH1Q13635 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PTCH1Q13635 TNNT2-202ENST00000360372 969 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PTCH1Q13635 TNNT2-204ENST00000367317 1050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PTCH1Q13635 AL512430.1-201ENST00000392575 860 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
PTCH1Q13635 ZFAND2B-205ENST00000409319 771 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PTCH1Q13635 MIR4435-2HG-204ENST00000419736 777 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PTCH1Q13635 TNNT2-209ENST00000421663 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PTCH1Q13635 SOX9-AS1-207ENST00000446332 443 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PTCH1Q13635 RPL7P35-201ENST00000446943 740 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
PTCH1Q13635 MYLK-AS1-202ENST00000470449 760 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PTCH1Q13635 PPFIBP1-204ENST00000535047 875 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PTCH1Q13635 LTBR-209ENST00000541102 1084 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PTCH1Q13635 C14orf132-204ENST00000556728 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PTCH1Q13635 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PTCH1Q13635 AC145207.3-201ENST00000576784 529 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PTCH1Q13635 MIR3188-201ENST00000583494 85 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
PTCH1Q13635 ZNF528-AS1-202ENST00000596746 929 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PTCH1Q13635 DDX5-235ENST00000630471 473 ntTSL 4 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PTCH1Q13635 PAK1IP1-201ENST00000379568 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PTCH1Q13635 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PTCH1Q13635 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PTCH1Q13635 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
PTCH1Q13635 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PTCH1Q13635 AL024498.2-201ENST00000480294 1589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PTCH1Q13635 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PTCH1Q13635 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PTCH1Q13635 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PTCH1Q13635 ACSF2-202ENST00000427954 2251 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PTCH1Q13635 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PTCH1Q13635 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PTCH1Q13635 AC018629.1-201ENST00000623381 1736 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
PTCH1Q13635 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PTCH1Q13635 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PTCH1Q13635 PRTFDC1-202ENST00000376376 741 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PTCH1Q13635 XBP1P1-201ENST00000436573 652 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
PTCH1Q13635 LAMA4-209ENST00000453937 645 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PTCH1Q13635 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PTCH1Q13635 APOC1P1-201ENST00000507983 630 ntTSL 4 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PTCH1Q13635 AL356756.1-201ENST00000550941 551 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PTCH1Q13635 ALKBH7-202ENST00000596657 603 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PTCH1Q13635 CMC2-224ENST00000630396 481 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PTCH1Q13635 CASP6-202ENST00000352981 1347 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PTCH1Q13635 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PTCH1Q13635 KRT8P31-201ENST00000504812 1408 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
PTCH1Q13635 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PTCH1Q13635 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PTCH1Q13635 FH-201ENST00000366560 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PTCH1Q13635 STK26-204ENST00000481105 1835 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PTCH1Q13635 PDE9A-208ENST00000398225 1963 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PTCH1Q13635 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PTCH1Q13635 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PTCH1Q13635 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PTCH1Q13635 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PTCH1Q13635 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PTCH1Q13635 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PTCH1Q13635 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
PTCH1Q13635 LAIR2-201ENST00000301202 699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
PTCH1Q13635 ORMDL1-204ENST00000409519 1223 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.91
PTCH1Q13635 SLC13A3-205ENST00000417157 876 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
PTCH1Q13635 HLA-DQB2-232ENST00000437316 1214 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.91
PTCH1Q13635 AL356056.1-201ENST00000437899 369 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
PTCH1Q13635 AP000358.1-201ENST00000456260 156 ntBASIC20.77■□□□□ 0.91
PTCH1Q13635 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
PTCH1Q13635 LINC02380-201ENST00000510956 1038 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
PTCH1Q13635 PCMTD1-207ENST00000522514 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
PTCH1Q13635 AL132709.1-203ENST00000555103 569 ntTSL 4 BASIC20.77■□□□□ 0.91
PTCH1Q13635 CRTC3-AS1-202ENST00000559531 657 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.91
PTCH1Q13635 LDLRAD4-208ENST00000586765 844 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
PTCH1Q13635 SLC25A19-205ENST00000442286 1496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
PTCH1Q13635 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
PTCH1Q13635 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
PTCH1Q13635 NTM-205ENST00000425719 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
PTCH1Q13635 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
PTCH1Q13635 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
PTCH1Q13635 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PTCH1Q13635 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PTCH1Q13635 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PTCH1Q13635 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PTCH1Q13635 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PTCH1Q13635 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PTCH1Q13635 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PTCH1Q13635 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PTCH1Q13635 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PTCH1Q13635 AC025271.4-201ENST00000621477 1726 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
PTCH1Q13635 FAM151A-202ENST00000371304 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PTCH1Q13635 LINC00334-203ENST00000638500 1377 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PTCH1Q13635 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PTCH1Q13635 RPP25L-202ENST00000378959 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
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