Protein–RNA interactions for Protein: Q13609

DNASE1L3, Deoxyribonuclease gamma, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNASE1L3Q13609 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
DNASE1L3Q13609 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
DNASE1L3Q13609 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
DNASE1L3Q13609 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
DNASE1L3Q13609 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
DNASE1L3Q13609 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
DNASE1L3Q13609 RSPRY1-202ENST00000537866 3586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
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DNASE1L3Q13609 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
DNASE1L3Q13609 RNF222-202ENST00000399398 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
DNASE1L3Q13609 ARNT2-204ENST00000527771 2458 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
DNASE1L3Q13609 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
DNASE1L3Q13609 GOPC-203ENST00000535237 4460 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
DNASE1L3Q13609 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
DNASE1L3Q13609 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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DNASE1L3Q13609 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
DNASE1L3Q13609 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
DNASE1L3Q13609 KIF17-201ENST00000247986 3969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
DNASE1L3Q13609 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
DNASE1L3Q13609 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
DNASE1L3Q13609 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
DNASE1L3Q13609 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
DNASE1L3Q13609 APBB1-221ENST00000609360 2642 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
DNASE1L3Q13609 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
DNASE1L3Q13609 TMPRSS3-204ENST00000433957 2403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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DNASE1L3Q13609 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
DNASE1L3Q13609 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
DNASE1L3Q13609 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
DNASE1L3Q13609 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
DNASE1L3Q13609 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
DNASE1L3Q13609 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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DNASE1L3Q13609 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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DNASE1L3Q13609 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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DNASE1L3Q13609 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
DNASE1L3Q13609 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
DNASE1L3Q13609 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
DNASE1L3Q13609 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
DNASE1L3Q13609 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
DNASE1L3Q13609 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
DNASE1L3Q13609 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
DNASE1L3Q13609 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
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