Protein–RNA interactions for Protein: Q13472

TOP3A, DNA topoisomerase 3-alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,001 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3AQ13472 ADAR-202ENST00000368474 6625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
TOP3AQ13472 MAP3K4-204ENST00000392142 5490 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
TOP3AQ13472 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
TOP3AQ13472 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
TOP3AQ13472 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
TOP3AQ13472 A1CF-202ENST00000373993 1997 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
TOP3AQ13472 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
TOP3AQ13472 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
TOP3AQ13472 ZNF790-207ENST00000614179 2361 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
TOP3AQ13472 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
TOP3AQ13472 STC1-202ENST00000524323 1748 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
TOP3AQ13472 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
TOP3AQ13472 TPD52L2-206ENST00000358548 2275 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
TOP3AQ13472 SPRED1-201ENST00000299084 7780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
TOP3AQ13472 SORCS1-201ENST00000263054 7272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
TOP3AQ13472 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
TOP3AQ13472 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
TOP3AQ13472 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
TOP3AQ13472 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
TOP3AQ13472 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
TOP3AQ13472 SIMC1-205ENST00000443967 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
TOP3AQ13472 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
TOP3AQ13472 TSPAN12-201ENST00000222747 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
TOP3AQ13472 ZNF664-204ENST00000538932 4321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
TOP3AQ13472 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
TOP3AQ13472 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
TOP3AQ13472 RBFADN-204ENST00000568911 5187 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
TOP3AQ13472 SFMBT1-201ENST00000394752 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
TOP3AQ13472 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
TOP3AQ13472 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
TOP3AQ13472 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
TOP3AQ13472 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
TOP3AQ13472 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
TOP3AQ13472 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
TOP3AQ13472 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
TOP3AQ13472 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
TOP3AQ13472 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
TOP3AQ13472 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
TOP3AQ13472 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
TOP3AQ13472 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
TOP3AQ13472 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
TOP3AQ13472 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
TOP3AQ13472 CYP1A1-207ENST00000567032 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
TOP3AQ13472 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
TOP3AQ13472 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
TOP3AQ13472 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
TOP3AQ13472 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
TOP3AQ13472 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
TOP3AQ13472 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
TOP3AQ13472 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
TOP3AQ13472 UVRAG-201ENST00000356136 4123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
TOP3AQ13472 THBS2-206ENST00000617924 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
TOP3AQ13472 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
TOP3AQ13472 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
TOP3AQ13472 IMPDH1-201ENST00000338791 2881 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
TOP3AQ13472 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
TOP3AQ13472 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
TOP3AQ13472 ZC3HAV1-203ENST00000464606 4776 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
TOP3AQ13472 AC090826.2-201ENST00000568496 4946 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
TOP3AQ13472 PLEKHN1-202ENST00000379409 2455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
TOP3AQ13472 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
TOP3AQ13472 ZNF596-201ENST00000308811 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
TOP3AQ13472 GPR132-203ENST00000539291 2779 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
TOP3AQ13472 DTX3L-201ENST00000296161 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
TOP3AQ13472 TRAF1-201ENST00000373887 6324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
TOP3AQ13472 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
TOP3AQ13472 GRIN2C-201ENST00000293190 4261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
TOP3AQ13472 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
TOP3AQ13472 STARD8-201ENST00000252336 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
TOP3AQ13472 UGT3A2-201ENST00000282507 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
TOP3AQ13472 CAMK2D-204ENST00000394522 2696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
TOP3AQ13472 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
TOP3AQ13472 ATXN2L-204ENST00000382686 3739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
TOP3AQ13472 NFATC4-219ENST00000555167 4364 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
TOP3AQ13472 ZNF785-202ENST00000470110 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
TOP3AQ13472 BCL9L-201ENST00000334801 10005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
TOP3AQ13472 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
TOP3AQ13472 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
TOP3AQ13472 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
TOP3AQ13472 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
TOP3AQ13472 AC005324.3-201ENST00000455584 5514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
TOP3AQ13472 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
TOP3AQ13472 P4HA1-205ENST00000440381 2790 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
TOP3AQ13472 KLF11-205ENST00000535335 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
TOP3AQ13472 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
TOP3AQ13472 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
TOP3AQ13472 POM121-201ENST00000358357 5320 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
TOP3AQ13472 LRIG3-201ENST00000320743 4070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
TOP3AQ13472 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
TOP3AQ13472 RREB1-202ENST00000349384 7440 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
TOP3AQ13472 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
TOP3AQ13472 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
TOP3AQ13472 GAL3ST4-202ENST00000411994 1404 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
TOP3AQ13472 KBTBD4-202ENST00000430070 2372 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
TOP3AQ13472 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
TOP3AQ13472 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
TOP3AQ13472 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
TOP3AQ13472 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
TOP3AQ13472 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
TOP3AQ13472 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.4 ms