Protein–RNA interactions for Protein: Q13367

AP3B2, AP-3 complex subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,082 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3B2Q13367 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
AP3B2Q13367 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
AP3B2Q13367 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
AP3B2Q13367 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
AP3B2Q13367 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
AP3B2Q13367 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
AP3B2Q13367 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
AP3B2Q13367 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
AP3B2Q13367 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
AP3B2Q13367 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
AP3B2Q13367 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
AP3B2Q13367 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
AP3B2Q13367 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
AP3B2Q13367 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
AP3B2Q13367 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
AP3B2Q13367 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
AP3B2Q13367 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
AP3B2Q13367 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
AP3B2Q13367 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
AP3B2Q13367 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
AP3B2Q13367 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
AP3B2Q13367 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
AP3B2Q13367 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
AP3B2Q13367 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
AP3B2Q13367 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
AP3B2Q13367 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
AP3B2Q13367 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
AP3B2Q13367 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
AP3B2Q13367 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
AP3B2Q13367 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
AP3B2Q13367 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
AP3B2Q13367 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
AP3B2Q13367 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
AP3B2Q13367 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
AP3B2Q13367 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
AP3B2Q13367 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
AP3B2Q13367 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
AP3B2Q13367 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
AP3B2Q13367 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
AP3B2Q13367 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
AP3B2Q13367 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
AP3B2Q13367 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
AP3B2Q13367 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
AP3B2Q13367 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
AP3B2Q13367 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
AP3B2Q13367 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
AP3B2Q13367 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
AP3B2Q13367 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
AP3B2Q13367 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
AP3B2Q13367 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
AP3B2Q13367 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
AP3B2Q13367 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
AP3B2Q13367 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
AP3B2Q13367 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
AP3B2Q13367 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
AP3B2Q13367 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
AP3B2Q13367 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
AP3B2Q13367 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
AP3B2Q13367 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
AP3B2Q13367 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
AP3B2Q13367 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.35
AP3B2Q13367 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
AP3B2Q13367 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
AP3B2Q13367 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
AP3B2Q13367 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
AP3B2Q13367 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
AP3B2Q13367 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
AP3B2Q13367 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
AP3B2Q13367 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
AP3B2Q13367 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
AP3B2Q13367 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
AP3B2Q13367 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
AP3B2Q13367 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
AP3B2Q13367 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
AP3B2Q13367 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
AP3B2Q13367 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
AP3B2Q13367 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
AP3B2Q13367 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
AP3B2Q13367 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
AP3B2Q13367 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
AP3B2Q13367 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
AP3B2Q13367 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
AP3B2Q13367 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
AP3B2Q13367 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
AP3B2Q13367 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
AP3B2Q13367 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
AP3B2Q13367 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
AP3B2Q13367 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
AP3B2Q13367 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
AP3B2Q13367 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
AP3B2Q13367 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
AP3B2Q13367 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
AP3B2Q13367 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
AP3B2Q13367 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
AP3B2Q13367 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
AP3B2Q13367 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
AP3B2Q13367 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
AP3B2Q13367 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
AP3B2Q13367 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
AP3B2Q13367 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
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