Protein–RNA interactions for Protein: Q13286

CLN3, Battenin, humanhuman

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN3Q13286 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
CLN3Q13286 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
CLN3Q13286 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
CLN3Q13286 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
CLN3Q13286 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
CLN3Q13286 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
CLN3Q13286 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
CLN3Q13286 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
CLN3Q13286 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
CLN3Q13286 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
CLN3Q13286 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
CLN3Q13286 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
CLN3Q13286 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
CLN3Q13286 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
CLN3Q13286 GSTT2B-201ENST00000290765 1099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
CLN3Q13286 NUDT1-203ENST00000356714 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
CLN3Q13286 FAM177A1-202ENST00000382406 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
CLN3Q13286 KRTAP20-4-201ENST00000382828 224 ntAPPRIS P1 BASIC14.32□□□□□ -0.12
CLN3Q13286 NUDT1-204ENST00000397046 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
CLN3Q13286 AL645608.5-201ENST00000398216 443 ntTSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
CLN3Q13286 FAM3B-203ENST00000398647 864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
CLN3Q13286 FAM3B-204ENST00000398652 1125 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
CLN3Q13286 ACTG1P2-201ENST00000415776 1125 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
CLN3Q13286 RPL17P11-201ENST00000417593 544 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
CLN3Q13286 AC007274.2-201ENST00000421675 662 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
CLN3Q13286 ACTG1P11-201ENST00000425411 1125 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
CLN3Q13286 LINC01352-201ENST00000431347 962 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
CLN3Q13286 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
CLN3Q13286 AP000356.1-201ENST00000438893 364 ntTSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
CLN3Q13286 CHMP1AP1-201ENST00000445563 662 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
CLN3Q13286 MTND4LP12-201ENST00000448237 295 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
CLN3Q13286 AC025165.3-201ENST00000471530 679 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
CLN3Q13286 AC021723.1-201ENST00000486306 515 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
CLN3Q13286 AC018680.1-202ENST00000500324 525 ntTSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
CLN3Q13286 C12orf73-211ENST00000553183 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
CLN3Q13286 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
CLN3Q13286 C15orf40-211ENST00000565712 559 ntTSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
CLN3Q13286 SRD5A3-AS1-211ENST00000599135 737 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
CLN3Q13286 AC022748.3-201ENST00000621828 275 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
CLN3Q13286 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
CLN3Q13286 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
CLN3Q13286 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
CLN3Q13286 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
CLN3Q13286 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
CLN3Q13286 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
CLN3Q13286 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
CLN3Q13286 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
CLN3Q13286 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
CLN3Q13286 KRT8P29-201ENST00000420409 1371 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
CLN3Q13286 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
CLN3Q13286 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
CLN3Q13286 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
CLN3Q13286 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
CLN3Q13286 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
CLN3Q13286 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
CLN3Q13286 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
CLN3Q13286 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
CLN3Q13286 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
CLN3Q13286 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
CLN3Q13286 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
CLN3Q13286 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
CLN3Q13286 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.31□□□□□ -0.12
CLN3Q13286 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
CLN3Q13286 SMARCE1-205ENST00000431889 1569 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
CLN3Q13286 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
CLN3Q13286 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
CLN3Q13286 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
CLN3Q13286 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
CLN3Q13286 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
CLN3Q13286 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
CLN3Q13286 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
CLN3Q13286 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
CLN3Q13286 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
CLN3Q13286 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
CLN3Q13286 SYCE2-201ENST00000293695 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
CLN3Q13286 LAMTOR4-201ENST00000341942 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
CLN3Q13286 DPM3-202ENST00000368399 517 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
CLN3Q13286 GSTK1-202ENST00000409500 888 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
CLN3Q13286 AC079807.2-203ENST00000417692 656 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
CLN3Q13286 AC060234.1-201ENST00000422966 474 ntTSL 3 BASIC14.31□□□□□ -0.12
CLN3Q13286 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
CLN3Q13286 AC008267.1-201ENST00000474858 1069 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
CLN3Q13286 PDC-202ENST00000497198 1174 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
CLN3Q13286 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
CLN3Q13286 AC239802.2-201ENST00000532137 554 ntTSL 4 BASIC14.31□□□□□ -0.12
CLN3Q13286 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
CLN3Q13286 TMEM208-207ENST00000563953 887 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
CLN3Q13286 FBXL12-204ENST00000586469 544 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
CLN3Q13286 AC063977.3-201ENST00000597569 547 ntTSL 4 BASIC14.31□□□□□ -0.12
CLN3Q13286 AL023803.2-201ENST00000620080 638 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
CLN3Q13286 ZNF596-213ENST00000640035 1163 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
CLN3Q13286 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.31□□□□□ -0.12
CLN3Q13286 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
CLN3Q13286 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
CLN3Q13286 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
CLN3Q13286 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
CLN3Q13286 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
CLN3Q13286 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
CLN3Q13286 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
CLN3Q13286 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
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