Protein–RNA interactions for Protein: Q13003

GRIK3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, humanhuman

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK3Q13003 AC009134.1-201ENST00000571939 443 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GRIK3Q13003 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GRIK3Q13003 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GRIK3Q13003 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GRIK3Q13003 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GRIK3Q13003 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GRIK3Q13003 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GRIK3Q13003 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GRIK3Q13003 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GRIK3Q13003 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
GRIK3Q13003 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GRIK3Q13003 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GRIK3Q13003 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GRIK3Q13003 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GRIK3Q13003 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GRIK3Q13003 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GRIK3Q13003 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GRIK3Q13003 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GRIK3Q13003 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GRIK3Q13003 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GRIK3Q13003 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GRIK3Q13003 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GRIK3Q13003 DDX59-206ENST00000447706 2900 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GRIK3Q13003 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GRIK3Q13003 CMTM6-201ENST00000205636 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GRIK3Q13003 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GRIK3Q13003 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GRIK3Q13003 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GRIK3Q13003 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GRIK3Q13003 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
GRIK3Q13003 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GRIK3Q13003 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GRIK3Q13003 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GRIK3Q13003 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GRIK3Q13003 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GRIK3Q13003 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GRIK3Q13003 AC009133.1-201ENST00000569981 2449 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GRIK3Q13003 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GRIK3Q13003 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GRIK3Q13003 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GRIK3Q13003 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GRIK3Q13003 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GRIK3Q13003 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GRIK3Q13003 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GRIK3Q13003 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GRIK3Q13003 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
GRIK3Q13003 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GRIK3Q13003 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GRIK3Q13003 LBHD1-201ENST00000354588 1320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GRIK3Q13003 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GRIK3Q13003 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GRIK3Q13003 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
GRIK3Q13003 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GRIK3Q13003 TPO-206ENST00000382269 1155 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GRIK3Q13003 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GRIK3Q13003 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GRIK3Q13003 MIR1908-201ENST00000410394 80 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
GRIK3Q13003 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GRIK3Q13003 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GRIK3Q13003 ACTBP11-201ENST00000436287 1126 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
GRIK3Q13003 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GRIK3Q13003 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GRIK3Q13003 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GRIK3Q13003 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GRIK3Q13003 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GRIK3Q13003 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
GRIK3Q13003 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
GRIK3Q13003 AC023310.1-201ENST00000554836 735 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
GRIK3Q13003 DUX4L45-201ENST00000566406 1057 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
GRIK3Q13003 AC020911.1-201ENST00000591038 578 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GRIK3Q13003 AC010328.2-201ENST00000597698 1111 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
GRIK3Q13003 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GRIK3Q13003 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GRIK3Q13003 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GRIK3Q13003 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GRIK3Q13003 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GRIK3Q13003 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GRIK3Q13003 MED20-201ENST00000265350 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GRIK3Q13003 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GRIK3Q13003 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GRIK3Q13003 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GRIK3Q13003 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GRIK3Q13003 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GRIK3Q13003 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GRIK3Q13003 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GRIK3Q13003 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GRIK3Q13003 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GRIK3Q13003 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GRIK3Q13003 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GRIK3Q13003 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
GRIK3Q13003 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GRIK3Q13003 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GRIK3Q13003 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GRIK3Q13003 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GRIK3Q13003 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GRIK3Q13003 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GRIK3Q13003 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GRIK3Q13003 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GRIK3Q13003 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
GRIK3Q13003 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.1 ms