Protein–RNA interactions for Protein: Q13002

GRIK2, Glutamate receptor ionotropic, kainate 2, humanhuman

Predictions only

Length 908 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK2Q13002 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GRIK2Q13002 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GRIK2Q13002 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GRIK2Q13002 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GRIK2Q13002 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GRIK2Q13002 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GRIK2Q13002 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GRIK2Q13002 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GRIK2Q13002 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GRIK2Q13002 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GRIK2Q13002 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GRIK2Q13002 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GRIK2Q13002 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GRIK2Q13002 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GRIK2Q13002 COX6A2-201ENST00000287490 440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GRIK2Q13002 POLD4-201ENST00000312419 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GRIK2Q13002 PPP1R14B-202ENST00000392210 600 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GRIK2Q13002 GTF2A2-204ENST00000396063 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GRIK2Q13002 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GRIK2Q13002 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
GRIK2Q13002 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GRIK2Q13002 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GRIK2Q13002 AC006033.1-201ENST00000440505 426 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
GRIK2Q13002 KRT8P13-201ENST00000463294 1010 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
GRIK2Q13002 LYRM9-204ENST00000503642 432 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GRIK2Q13002 AC080188.2-201ENST00000508985 552 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GRIK2Q13002 PARP8-218ENST00000513738 596 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GRIK2Q13002 GTF2H2C-215ENST00000514162 610 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GRIK2Q13002 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GRIK2Q13002 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GRIK2Q13002 TMEM219-203ENST00000561899 1249 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GRIK2Q13002 AC009093.8-202ENST00000562902 677 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GRIK2Q13002 TSR1-204ENST00000576112 1290 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GRIK2Q13002 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GRIK2Q13002 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GRIK2Q13002 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GRIK2Q13002 AL118558.3-201ENST00000607414 1079 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
GRIK2Q13002 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GRIK2Q13002 ABBA01031663.1-201ENST00000635630 790 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
GRIK2Q13002 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GRIK2Q13002 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GRIK2Q13002 RGS6-218ENST00000556437 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GRIK2Q13002 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GRIK2Q13002 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GRIK2Q13002 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GRIK2Q13002 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GRIK2Q13002 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GRIK2Q13002 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GRIK2Q13002 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GRIK2Q13002 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GRIK2Q13002 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GRIK2Q13002 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GRIK2Q13002 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GRIK2Q13002 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GRIK2Q13002 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GRIK2Q13002 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GRIK2Q13002 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GRIK2Q13002 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GRIK2Q13002 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GRIK2Q13002 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GRIK2Q13002 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GRIK2Q13002 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GRIK2Q13002 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GRIK2Q13002 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GRIK2Q13002 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GRIK2Q13002 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GRIK2Q13002 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GRIK2Q13002 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GRIK2Q13002 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GRIK2Q13002 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GRIK2Q13002 MIR326-201ENST00000362220 95 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
GRIK2Q13002 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GRIK2Q13002 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GRIK2Q13002 LINC01665-201ENST00000422917 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GRIK2Q13002 BTNL8-205ENST00000505126 1294 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GRIK2Q13002 AC023310.1-201ENST00000554836 735 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
GRIK2Q13002 DBNDD1-206ENST00000568838 993 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GRIK2Q13002 CRISPLD2-210ENST00000569090 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GRIK2Q13002 AP002360.2-202ENST00000572035 738 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GRIK2Q13002 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GRIK2Q13002 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GRIK2Q13002 PLA2G4C-AS1-201ENST00000596552 568 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GRIK2Q13002 ZNF347-208ENST00000601804 496 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GRIK2Q13002 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GRIK2Q13002 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GRIK2Q13002 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GRIK2Q13002 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GRIK2Q13002 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GRIK2Q13002 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GRIK2Q13002 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GRIK2Q13002 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GRIK2Q13002 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GRIK2Q13002 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GRIK2Q13002 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GRIK2Q13002 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GRIK2Q13002 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GRIK2Q13002 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GRIK2Q13002 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GRIK2Q13002 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GRIK2Q13002 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms