Protein–RNA interactions for Protein: Q12947

FOXF2, Forkhead box protein F2, humanhuman

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Length 444 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF2Q12947 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
FOXF2Q12947 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
FOXF2Q12947 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
FOXF2Q12947 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
FOXF2Q12947 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
FOXF2Q12947 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
FOXF2Q12947 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
FOXF2Q12947 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
FOXF2Q12947 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
FOXF2Q12947 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
FOXF2Q12947 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
FOXF2Q12947 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
FOXF2Q12947 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
FOXF2Q12947 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
FOXF2Q12947 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
FOXF2Q12947 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
FOXF2Q12947 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
FOXF2Q12947 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
FOXF2Q12947 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
FOXF2Q12947 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
FOXF2Q12947 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
FOXF2Q12947 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
FOXF2Q12947 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
FOXF2Q12947 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
FOXF2Q12947 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
FOXF2Q12947 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
FOXF2Q12947 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
FOXF2Q12947 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
FOXF2Q12947 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
FOXF2Q12947 PSMC3-212ENST00000602866 1373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
FOXF2Q12947 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
FOXF2Q12947 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
FOXF2Q12947 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
FOXF2Q12947 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
FOXF2Q12947 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
FOXF2Q12947 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
FOXF2Q12947 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
FOXF2Q12947 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
FOXF2Q12947 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
FOXF2Q12947 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
FOXF2Q12947 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
FOXF2Q12947 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
FOXF2Q12947 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
FOXF2Q12947 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
FOXF2Q12947 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
FOXF2Q12947 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
FOXF2Q12947 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
FOXF2Q12947 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
FOXF2Q12947 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
FOXF2Q12947 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
FOXF2Q12947 VAMP4-202ENST00000367740 1193 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
FOXF2Q12947 CSAG1-202ENST00000370287 875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
FOXF2Q12947 TCEAL1-203ENST00000372626 721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
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FOXF2Q12947 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
FOXF2Q12947 SAP30L-202ENST00000426761 777 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
FOXF2Q12947 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
FOXF2Q12947 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
FOXF2Q12947 CNN2P10-201ENST00000443067 918 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
FOXF2Q12947 GTF2H2C-215ENST00000514162 610 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
FOXF2Q12947 CD74-212ENST00000524315 584 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
FOXF2Q12947 BLOC1S1-205ENST00000551926 531 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
FOXF2Q12947 AF111167.2-202ENST00000558267 599 ntTSL 4 BASIC13.45□□□□□ -0.26
FOXF2Q12947 IGHV3OR16-9-202ENST00000558425 288 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
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FOXF2Q12947 CRISPLD2-210ENST00000569090 808 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
FOXF2Q12947 AC244093.1-201ENST00000610837 814 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
FOXF2Q12947 PRKN-211ENST00000615065 261 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
FOXF2Q12947 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
FOXF2Q12947 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
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FOXF2Q12947 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
FOXF2Q12947 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
FOXF2Q12947 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
FOXF2Q12947 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
FOXF2Q12947 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
FOXF2Q12947 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
FOXF2Q12947 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
FOXF2Q12947 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
FOXF2Q12947 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
FOXF2Q12947 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
FOXF2Q12947 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
FOXF2Q12947 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
FOXF2Q12947 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
FOXF2Q12947 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
FOXF2Q12947 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
FOXF2Q12947 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
FOXF2Q12947 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
FOXF2Q12947 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
FOXF2Q12947 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
FOXF2Q12947 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
FOXF2Q12947 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
FOXF2Q12947 COX6A2-201ENST00000287490 440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
FOXF2Q12947 CCDC88B-201ENST00000301897 870 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
FOXF2Q12947 CIDEC-201ENST00000336832 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
FOXF2Q12947 TSHR-202ENST00000342443 1281 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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