Protein–RNA interactions for Protein: Q10567

AP1B1, AP-1 complex subunit beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 949 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP1B1Q10567 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
AP1B1Q10567 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
AP1B1Q10567 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
AP1B1Q10567 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
AP1B1Q10567 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
AP1B1Q10567 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
AP1B1Q10567 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
AP1B1Q10567 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
AP1B1Q10567 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
AP1B1Q10567 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
AP1B1Q10567 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
AP1B1Q10567 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
AP1B1Q10567 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
AP1B1Q10567 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
AP1B1Q10567 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
AP1B1Q10567 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
AP1B1Q10567 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
AP1B1Q10567 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
AP1B1Q10567 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
AP1B1Q10567 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
AP1B1Q10567 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
AP1B1Q10567 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
AP1B1Q10567 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
AP1B1Q10567 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
AP1B1Q10567 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
AP1B1Q10567 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
AP1B1Q10567 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
AP1B1Q10567 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
AP1B1Q10567 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
AP1B1Q10567 CDS2-203ENST00000460006 9298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
AP1B1Q10567 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
AP1B1Q10567 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
AP1B1Q10567 SPN-201ENST00000360121 6894 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
AP1B1Q10567 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
AP1B1Q10567 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
AP1B1Q10567 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
AP1B1Q10567 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
AP1B1Q10567 ZFP30-201ENST00000351218 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
AP1B1Q10567 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
AP1B1Q10567 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
AP1B1Q10567 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
AP1B1Q10567 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
AP1B1Q10567 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
AP1B1Q10567 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
AP1B1Q10567 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
AP1B1Q10567 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
AP1B1Q10567 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
AP1B1Q10567 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
AP1B1Q10567 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
AP1B1Q10567 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
AP1B1Q10567 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
AP1B1Q10567 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
AP1B1Q10567 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
AP1B1Q10567 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
AP1B1Q10567 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
AP1B1Q10567 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
AP1B1Q10567 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
AP1B1Q10567 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
AP1B1Q10567 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
AP1B1Q10567 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
AP1B1Q10567 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
AP1B1Q10567 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
AP1B1Q10567 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
AP1B1Q10567 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
AP1B1Q10567 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
AP1B1Q10567 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
AP1B1Q10567 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
AP1B1Q10567 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
AP1B1Q10567 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
AP1B1Q10567 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
AP1B1Q10567 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
AP1B1Q10567 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
AP1B1Q10567 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
AP1B1Q10567 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
AP1B1Q10567 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
AP1B1Q10567 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
AP1B1Q10567 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
AP1B1Q10567 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
AP1B1Q10567 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
AP1B1Q10567 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
AP1B1Q10567 DMTN-203ENST00000381470 2601 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
AP1B1Q10567 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
AP1B1Q10567 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
AP1B1Q10567 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
AP1B1Q10567 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
AP1B1Q10567 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
AP1B1Q10567 UBE2I-201ENST00000325437 2832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
AP1B1Q10567 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
AP1B1Q10567 ZNF831-201ENST00000371030 9401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
AP1B1Q10567 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
AP1B1Q10567 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
AP1B1Q10567 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
AP1B1Q10567 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
AP1B1Q10567 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
AP1B1Q10567 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
AP1B1Q10567 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
AP1B1Q10567 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
AP1B1Q10567 KDM2B-201ENST00000377069 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
AP1B1Q10567 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
AP1B1Q10567 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms