Protein–RNA interactions for Protein: Q08AF3

SLFN5, Schlafen family member 5, humanhuman

Predictions only

Length 891 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLFN5Q08AF3 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SLFN5Q08AF3 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SLFN5Q08AF3 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SLFN5Q08AF3 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SLFN5Q08AF3 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SLFN5Q08AF3 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SLFN5Q08AF3 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SLFN5Q08AF3 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SLFN5Q08AF3 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SLFN5Q08AF3 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SLFN5Q08AF3 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SLFN5Q08AF3 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SLFN5Q08AF3 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
SLFN5Q08AF3 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SLFN5Q08AF3 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SLFN5Q08AF3 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SLFN5Q08AF3 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
SLFN5Q08AF3 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
SLFN5Q08AF3 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
SLFN5Q08AF3 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SLFN5Q08AF3 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SLFN5Q08AF3 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SLFN5Q08AF3 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SLFN5Q08AF3 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SLFN5Q08AF3 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SLFN5Q08AF3 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SLFN5Q08AF3 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SLFN5Q08AF3 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SLFN5Q08AF3 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
SLFN5Q08AF3 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SLFN5Q08AF3 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SLFN5Q08AF3 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SLFN5Q08AF3 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SLFN5Q08AF3 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SLFN5Q08AF3 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SLFN5Q08AF3 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SLFN5Q08AF3 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SLFN5Q08AF3 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SLFN5Q08AF3 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SLFN5Q08AF3 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SLFN5Q08AF3 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SLFN5Q08AF3 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SLFN5Q08AF3 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SLFN5Q08AF3 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SLFN5Q08AF3 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SLFN5Q08AF3 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SLFN5Q08AF3 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SLFN5Q08AF3 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
SLFN5Q08AF3 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SLFN5Q08AF3 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
SLFN5Q08AF3 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
SLFN5Q08AF3 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SLFN5Q08AF3 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SLFN5Q08AF3 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SLFN5Q08AF3 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SLFN5Q08AF3 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SLFN5Q08AF3 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SLFN5Q08AF3 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SLFN5Q08AF3 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SLFN5Q08AF3 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SLFN5Q08AF3 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SLFN5Q08AF3 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SLFN5Q08AF3 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
SLFN5Q08AF3 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
SLFN5Q08AF3 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
SLFN5Q08AF3 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
SLFN5Q08AF3 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
SLFN5Q08AF3 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
SLFN5Q08AF3 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
SLFN5Q08AF3 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
SLFN5Q08AF3 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
SLFN5Q08AF3 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
SLFN5Q08AF3 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
SLFN5Q08AF3 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
SLFN5Q08AF3 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
SLFN5Q08AF3 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
SLFN5Q08AF3 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
SLFN5Q08AF3 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
SLFN5Q08AF3 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
SLFN5Q08AF3 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
SLFN5Q08AF3 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC19.77■□□□□ 0.76
SLFN5Q08AF3 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
SLFN5Q08AF3 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
SLFN5Q08AF3 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
SLFN5Q08AF3 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.75
SLFN5Q08AF3 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SLFN5Q08AF3 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SLFN5Q08AF3 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SLFN5Q08AF3 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SLFN5Q08AF3 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SLFN5Q08AF3 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SLFN5Q08AF3 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SLFN5Q08AF3 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SLFN5Q08AF3 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SLFN5Q08AF3 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SLFN5Q08AF3 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SLFN5Q08AF3 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SLFN5Q08AF3 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
SLFN5Q08AF3 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SLFN5Q08AF3 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 124.5 ms