Protein–RNA interactions for Protein: Q03060

CREM, cAMP-responsive element modulator, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREMQ03060 FBXL12-204ENST00000586469 544 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CREMQ03060 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CREMQ03060 IFITM3-204ENST00000602735 713 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CREMQ03060 TUBB3-215ENST00000625617 570 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CREMQ03060 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CREMQ03060 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CREMQ03060 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CREMQ03060 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CREMQ03060 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CREMQ03060 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CREMQ03060 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CREMQ03060 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CREMQ03060 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CREMQ03060 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CREMQ03060 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CREMQ03060 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CREMQ03060 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CREMQ03060 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CREMQ03060 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CREMQ03060 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CREMQ03060 KRTAP21-2-201ENST00000333892 440 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CREMQ03060 ZNF789-204ENST00000448667 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CREMQ03060 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CREMQ03060 AC113192.2-201ENST00000525320 308 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CREMQ03060 ACTG1P17-201ENST00000558391 1119 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CREMQ03060 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CREMQ03060 AL451050.2-201ENST00000606967 682 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CREMQ03060 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CREMQ03060 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CREMQ03060 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CREMQ03060 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CREMQ03060 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CREMQ03060 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CREMQ03060 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CREMQ03060 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CREMQ03060 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CREMQ03060 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CREMQ03060 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CREMQ03060 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CREMQ03060 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CREMQ03060 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CREMQ03060 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CREMQ03060 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CREMQ03060 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CREMQ03060 KRT8P29-201ENST00000420409 1371 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CREMQ03060 MAPK14-204ENST00000468133 1376 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CREMQ03060 CALM1-216ENST00000626705 1341 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CREMQ03060 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CREMQ03060 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CREMQ03060 VSIG2-201ENST00000326621 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CREMQ03060 ZNF248-202ENST00000374648 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CREMQ03060 TXNRD3NB-202ENST00000383572 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CREMQ03060 MIR769-201ENST00000390225 118 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CREMQ03060 AC092506.1-202ENST00000401022 528 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CREMQ03060 REEP1-202ENST00000453231 940 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CREMQ03060 AL157935.2-201ENST00000476274 1071 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CREMQ03060 LILRA5-204ENST00000486742 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CREMQ03060 AC106794.1-201ENST00000506935 792 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CREMQ03060 AC090502.1-202ENST00000515416 966 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CREMQ03060 AC005833.2-201ENST00000527518 1249 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CREMQ03060 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CREMQ03060 AC025154.1-201ENST00000552806 560 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CREMQ03060 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CREMQ03060 STPG3-204ENST00000611378 1015 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CREMQ03060 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CREMQ03060 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CREMQ03060 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CREMQ03060 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CREMQ03060 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CREMQ03060 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CREMQ03060 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CREMQ03060 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CREMQ03060 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CREMQ03060 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CREMQ03060 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CREMQ03060 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CREMQ03060 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CREMQ03060 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CREMQ03060 LINC01667-202ENST00000623919 1422 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CREMQ03060 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CREMQ03060 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CREMQ03060 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CREMQ03060 C7orf33-201ENST00000307003 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CREMQ03060 COL9A1-204ENST00000370496 1372 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CREMQ03060 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CREMQ03060 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CREMQ03060 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CREMQ03060 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CREMQ03060 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CREMQ03060 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CREMQ03060 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CREMQ03060 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CREMQ03060 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CREMQ03060 AKIP1-201ENST00000299576 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CREMQ03060 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CREMQ03060 YIPF7-201ENST00000332990 937 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CREMQ03060 FAM24B-202ENST00000368898 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CREMQ03060 PPIE-203ENST00000372830 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CREMQ03060 SMS-201ENST00000379404 1174 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CREMQ03060 MAPK15-203ENST00000395108 765 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.7 ms