Protein–RNA interactions for Protein: Q02818

NUCB1, Nucleobindin-1, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUCB1Q02818 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
NUCB1Q02818 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
NUCB1Q02818 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NUCB1Q02818 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NUCB1Q02818 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NUCB1Q02818 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NUCB1Q02818 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
NUCB1Q02818 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
NUCB1Q02818 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
NUCB1Q02818 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NUCB1Q02818 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NUCB1Q02818 BX640514.1-201ENST00000583223 1918 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
NUCB1Q02818 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
NUCB1Q02818 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC18.85■□□□□ 0.61
NUCB1Q02818 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
NUCB1Q02818 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
NUCB1Q02818 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
NUCB1Q02818 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
NUCB1Q02818 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
NUCB1Q02818 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
NUCB1Q02818 ZNF84-215ENST00000543758 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
NUCB1Q02818 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NUCB1Q02818 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NUCB1Q02818 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NUCB1Q02818 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
NUCB1Q02818 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
NUCB1Q02818 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
NUCB1Q02818 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
NUCB1Q02818 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
NUCB1Q02818 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
NUCB1Q02818 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
NUCB1Q02818 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
NUCB1Q02818 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
NUCB1Q02818 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
NUCB1Q02818 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
NUCB1Q02818 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
NUCB1Q02818 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
NUCB1Q02818 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
NUCB1Q02818 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
NUCB1Q02818 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
NUCB1Q02818 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
NUCB1Q02818 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
NUCB1Q02818 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
NUCB1Q02818 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
NUCB1Q02818 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
NUCB1Q02818 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC18.84■□□□□ 0.61
NUCB1Q02818 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
NUCB1Q02818 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
NUCB1Q02818 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
NUCB1Q02818 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
NUCB1Q02818 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC18.84■□□□□ 0.61
NUCB1Q02818 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
NUCB1Q02818 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
NUCB1Q02818 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
NUCB1Q02818 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
NUCB1Q02818 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
NUCB1Q02818 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
NUCB1Q02818 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
NUCB1Q02818 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
NUCB1Q02818 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
NUCB1Q02818 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
NUCB1Q02818 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
NUCB1Q02818 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
NUCB1Q02818 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
NUCB1Q02818 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
NUCB1Q02818 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
NUCB1Q02818 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
NUCB1Q02818 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.61
NUCB1Q02818 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
NUCB1Q02818 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
NUCB1Q02818 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
NUCB1Q02818 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
NUCB1Q02818 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
NUCB1Q02818 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
NUCB1Q02818 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
NUCB1Q02818 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
NUCB1Q02818 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
NUCB1Q02818 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
NUCB1Q02818 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
NUCB1Q02818 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
NUCB1Q02818 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
NUCB1Q02818 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
NUCB1Q02818 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
NUCB1Q02818 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
NUCB1Q02818 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
NUCB1Q02818 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
NUCB1Q02818 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
NUCB1Q02818 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
NUCB1Q02818 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
NUCB1Q02818 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
NUCB1Q02818 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
NUCB1Q02818 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
NUCB1Q02818 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
NUCB1Q02818 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
NUCB1Q02818 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
NUCB1Q02818 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
NUCB1Q02818 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
NUCB1Q02818 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
NUCB1Q02818 PYGM-202ENST00000377432 2611 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
NUCB1Q02818 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.4 ms