Protein–RNA interactions for Protein: Q02223

TNFRSF17, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 17, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF17Q02223 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
TNFRSF17Q02223 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
TNFRSF17Q02223 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
TNFRSF17Q02223 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
TNFRSF17Q02223 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
TNFRSF17Q02223 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
TNFRSF17Q02223 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
TNFRSF17Q02223 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
TNFRSF17Q02223 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
TNFRSF17Q02223 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
TNFRSF17Q02223 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
TNFRSF17Q02223 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
TNFRSF17Q02223 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
TNFRSF17Q02223 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
TNFRSF17Q02223 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
TNFRSF17Q02223 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
TNFRSF17Q02223 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
TNFRSF17Q02223 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
TNFRSF17Q02223 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
TNFRSF17Q02223 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
TNFRSF17Q02223 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
TNFRSF17Q02223 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
TNFRSF17Q02223 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.09
TNFRSF17Q02223 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
TNFRSF17Q02223 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
TNFRSF17Q02223 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
TNFRSF17Q02223 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
TNFRSF17Q02223 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
TNFRSF17Q02223 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
TNFRSF17Q02223 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
TNFRSF17Q02223 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
TNFRSF17Q02223 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
TNFRSF17Q02223 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
TNFRSF17Q02223 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
TNFRSF17Q02223 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
TNFRSF17Q02223 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
TNFRSF17Q02223 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
TNFRSF17Q02223 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
TNFRSF17Q02223 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
TNFRSF17Q02223 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
TNFRSF17Q02223 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
TNFRSF17Q02223 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
TNFRSF17Q02223 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
TNFRSF17Q02223 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
TNFRSF17Q02223 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
TNFRSF17Q02223 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
TNFRSF17Q02223 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
TNFRSF17Q02223 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.1
TNFRSF17Q02223 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.1
TNFRSF17Q02223 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
TNFRSF17Q02223 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
TNFRSF17Q02223 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
TNFRSF17Q02223 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
TNFRSF17Q02223 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC14.46□□□□□ -0.1
TNFRSF17Q02223 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
TNFRSF17Q02223 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
TNFRSF17Q02223 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
TNFRSF17Q02223 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
TNFRSF17Q02223 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
TNFRSF17Q02223 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
TNFRSF17Q02223 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
TNFRSF17Q02223 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
TNFRSF17Q02223 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
TNFRSF17Q02223 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
TNFRSF17Q02223 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
TNFRSF17Q02223 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
TNFRSF17Q02223 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
TNFRSF17Q02223 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
TNFRSF17Q02223 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
TNFRSF17Q02223 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
TNFRSF17Q02223 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
TNFRSF17Q02223 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
TNFRSF17Q02223 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
TNFRSF17Q02223 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
TNFRSF17Q02223 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
TNFRSF17Q02223 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
TNFRSF17Q02223 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
TNFRSF17Q02223 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
TNFRSF17Q02223 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
TNFRSF17Q02223 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
TNFRSF17Q02223 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
TNFRSF17Q02223 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
TNFRSF17Q02223 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
TNFRSF17Q02223 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
TNFRSF17Q02223 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
TNFRSF17Q02223 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
TNFRSF17Q02223 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
TNFRSF17Q02223 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
TNFRSF17Q02223 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
TNFRSF17Q02223 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
TNFRSF17Q02223 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
TNFRSF17Q02223 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
TNFRSF17Q02223 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
TNFRSF17Q02223 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
TNFRSF17Q02223 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
TNFRSF17Q02223 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
TNFRSF17Q02223 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
TNFRSF17Q02223 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
TNFRSF17Q02223 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
TNFRSF17Q02223 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60 ms