Protein–RNA interactions for Protein: P86397

HTD2, Hydroxyacyl-thioester dehydratase type 2, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 168 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTD2P86397 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
HTD2P86397 IRS1-201ENST00000305123 9705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
HTD2P86397 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
HTD2P86397 NHSL1-202ENST00000343505 6535 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
HTD2P86397 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
HTD2P86397 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
HTD2P86397 TNS2-202ENST00000314276 4944 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
HTD2P86397 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
HTD2P86397 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
HTD2P86397 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
HTD2P86397 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
HTD2P86397 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
HTD2P86397 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
HTD2P86397 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
HTD2P86397 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
HTD2P86397 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
HTD2P86397 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
HTD2P86397 LAMB2-202ENST00000418109 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
HTD2P86397 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
HTD2P86397 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
HTD2P86397 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
HTD2P86397 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
HTD2P86397 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
HTD2P86397 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
HTD2P86397 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
HTD2P86397 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
HTD2P86397 PTENP1-202ENST00000532280 3996 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
HTD2P86397 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
HTD2P86397 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
HTD2P86397 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
HTD2P86397 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
HTD2P86397 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
HTD2P86397 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
HTD2P86397 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
HTD2P86397 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
HTD2P86397 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
HTD2P86397 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
HTD2P86397 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
HTD2P86397 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
HTD2P86397 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
HTD2P86397 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
HTD2P86397 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
HTD2P86397 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
HTD2P86397 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
HTD2P86397 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
HTD2P86397 DLGAP1-204ENST00000400149 5203 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
HTD2P86397 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
HTD2P86397 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
HTD2P86397 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
HTD2P86397 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
HTD2P86397 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
HTD2P86397 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
HTD2P86397 EFR3B-202ENST00000401432 5162 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
HTD2P86397 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
HTD2P86397 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
HTD2P86397 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
HTD2P86397 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
HTD2P86397 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
HTD2P86397 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
HTD2P86397 E2F7-201ENST00000322886 5740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
HTD2P86397 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
HTD2P86397 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
HTD2P86397 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
HTD2P86397 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
HTD2P86397 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
HTD2P86397 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
HTD2P86397 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
HTD2P86397 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
HTD2P86397 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
HTD2P86397 AMOTL2-201ENST00000249883 4488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
HTD2P86397 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
HTD2P86397 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
HTD2P86397 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
HTD2P86397 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
HTD2P86397 MED14-201ENST00000324817 7984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
HTD2P86397 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
HTD2P86397 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
HTD2P86397 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
HTD2P86397 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
HTD2P86397 TFAM-204ENST00000487519 5414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
HTD2P86397 SETD1B-202ENST00000542440 8185 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
HTD2P86397 POM121-205ENST00000627934 5480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
HTD2P86397 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
HTD2P86397 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
HTD2P86397 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
HTD2P86397 UBQLN1-202ENST00000376395 4118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
HTD2P86397 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
HTD2P86397 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
HTD2P86397 SMARCA4-202ENST00000413806 5512 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
HTD2P86397 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
HTD2P86397 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
HTD2P86397 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
HTD2P86397 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
HTD2P86397 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
HTD2P86397 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
HTD2P86397 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
HTD2P86397 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
HTD2P86397 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
HTD2P86397 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
HTD2P86397 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms