Protein–RNA interactions for Protein: P78314

SH3BP2, SH3 domain-binding protein 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2P78314 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SH3BP2P78314 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SH3BP2P78314 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SH3BP2P78314 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SH3BP2P78314 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SH3BP2P78314 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SH3BP2P78314 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SH3BP2P78314 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SH3BP2P78314 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SH3BP2P78314 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SH3BP2P78314 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SH3BP2P78314 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SH3BP2P78314 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SH3BP2P78314 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SH3BP2P78314 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SH3BP2P78314 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SH3BP2P78314 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
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SH3BP2P78314 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SH3BP2P78314 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SH3BP2P78314 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SH3BP2P78314 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SH3BP2P78314 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SH3BP2P78314 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SH3BP2P78314 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SH3BP2P78314 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SH3BP2P78314 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SH3BP2P78314 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SH3BP2P78314 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SH3BP2P78314 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SH3BP2P78314 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SH3BP2P78314 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SH3BP2P78314 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SH3BP2P78314 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SH3BP2P78314 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SH3BP2P78314 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SH3BP2P78314 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SH3BP2P78314 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SH3BP2P78314 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SH3BP2P78314 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SH3BP2P78314 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SH3BP2P78314 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SH3BP2P78314 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SH3BP2P78314 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SH3BP2P78314 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SH3BP2P78314 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SH3BP2P78314 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SH3BP2P78314 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SH3BP2P78314 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SH3BP2P78314 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SH3BP2P78314 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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SH3BP2P78314 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
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SH3BP2P78314 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SH3BP2P78314 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
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SH3BP2P78314 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SH3BP2P78314 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SH3BP2P78314 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SH3BP2P78314 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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SH3BP2P78314 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SH3BP2P78314 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SH3BP2P78314 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SH3BP2P78314 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SH3BP2P78314 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SH3BP2P78314 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SH3BP2P78314 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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SH3BP2P78314 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SH3BP2P78314 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SH3BP2P78314 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SH3BP2P78314 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SH3BP2P78314 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SH3BP2P78314 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SH3BP2P78314 ARL4AP4-201ENST00000434170 518 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SH3BP2P78314 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SH3BP2P78314 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SH3BP2P78314 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SH3BP2P78314 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SH3BP2P78314 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SH3BP2P78314 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SH3BP2P78314 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SH3BP2P78314 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SH3BP2P78314 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SH3BP2P78314 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
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