Protein–RNA interactions for Protein: P59942

MCCD1, Mitochondrial coiled-coil domain protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCCD1P59942 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
MCCD1P59942 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
MCCD1P59942 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
MCCD1P59942 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
MCCD1P59942 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
MCCD1P59942 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
MCCD1P59942 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
MCCD1P59942 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
MCCD1P59942 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
MCCD1P59942 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
MCCD1P59942 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
MCCD1P59942 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
MCCD1P59942 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
MCCD1P59942 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
MCCD1P59942 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
MCCD1P59942 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
MCCD1P59942 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
MCCD1P59942 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.19
MCCD1P59942 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
MCCD1P59942 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
MCCD1P59942 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
MCCD1P59942 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
MCCD1P59942 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
MCCD1P59942 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
MCCD1P59942 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
MCCD1P59942 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
MCCD1P59942 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
MCCD1P59942 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
MCCD1P59942 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
MCCD1P59942 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
MCCD1P59942 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
MCCD1P59942 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
MCCD1P59942 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
MCCD1P59942 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
MCCD1P59942 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
MCCD1P59942 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
MCCD1P59942 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
MCCD1P59942 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
MCCD1P59942 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
MCCD1P59942 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
MCCD1P59942 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
MCCD1P59942 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
MCCD1P59942 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
MCCD1P59942 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
MCCD1P59942 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
MCCD1P59942 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
MCCD1P59942 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
MCCD1P59942 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
MCCD1P59942 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
MCCD1P59942 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
MCCD1P59942 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
MCCD1P59942 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
MCCD1P59942 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
MCCD1P59942 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
MCCD1P59942 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
MCCD1P59942 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
MCCD1P59942 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
MCCD1P59942 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
MCCD1P59942 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
MCCD1P59942 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
MCCD1P59942 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
MCCD1P59942 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
MCCD1P59942 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
MCCD1P59942 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
MCCD1P59942 ORMDL3-202ENST00000394169 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
MCCD1P59942 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
MCCD1P59942 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
MCCD1P59942 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
MCCD1P59942 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
MCCD1P59942 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
MCCD1P59942 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
MCCD1P59942 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
MCCD1P59942 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
MCCD1P59942 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
MCCD1P59942 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
MCCD1P59942 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
MCCD1P59942 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MCCD1P59942 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
MCCD1P59942 BTNL8-206ENST00000508408 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MCCD1P59942 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MCCD1P59942 RUFY1-202ENST00000393438 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MCCD1P59942 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MCCD1P59942 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
MCCD1P59942 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
MCCD1P59942 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
MCCD1P59942 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
MCCD1P59942 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MCCD1P59942 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MCCD1P59942 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
MCCD1P59942 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
MCCD1P59942 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
MCCD1P59942 GCOM2-201ENST00000509133 1104 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
MCCD1P59942 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
MCCD1P59942 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MCCD1P59942 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
MCCD1P59942 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
MCCD1P59942 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
MCCD1P59942 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
MCCD1P59942 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
MCCD1P59942 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.9 ms