Protein–RNA interactions for Protein: P56748

CLDN8, Claudin-8, humanhuman

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Length 225 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN8P56748 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CLDN8P56748 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CLDN8P56748 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CLDN8P56748 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
CLDN8P56748 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CLDN8P56748 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CLDN8P56748 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CLDN8P56748 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CLDN8P56748 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CLDN8P56748 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
CLDN8P56748 FER1L4-213ENST00000621044 2778 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CLDN8P56748 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CLDN8P56748 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CLDN8P56748 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CLDN8P56748 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CLDN8P56748 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CLDN8P56748 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CLDN8P56748 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CLDN8P56748 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CLDN8P56748 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CLDN8P56748 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CLDN8P56748 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CLDN8P56748 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
CLDN8P56748 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CLDN8P56748 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
CLDN8P56748 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CLDN8P56748 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CLDN8P56748 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CLDN8P56748 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
CLDN8P56748 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CLDN8P56748 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CLDN8P56748 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
CLDN8P56748 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CLDN8P56748 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
CLDN8P56748 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CLDN8P56748 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CLDN8P56748 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CLDN8P56748 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
CLDN8P56748 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CLDN8P56748 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CLDN8P56748 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CLDN8P56748 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CLDN8P56748 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CLDN8P56748 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CLDN8P56748 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
CLDN8P56748 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CLDN8P56748 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CLDN8P56748 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
CLDN8P56748 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CLDN8P56748 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CLDN8P56748 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CLDN8P56748 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CLDN8P56748 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CLDN8P56748 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CLDN8P56748 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
CLDN8P56748 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
CLDN8P56748 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
CLDN8P56748 BX640514.1-201ENST00000583223 1918 ntBASIC14.58□□□□□ -0.07
CLDN8P56748 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
CLDN8P56748 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
CLDN8P56748 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
CLDN8P56748 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
CLDN8P56748 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
CLDN8P56748 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
CLDN8P56748 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
CLDN8P56748 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
CLDN8P56748 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
CLDN8P56748 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CLDN8P56748 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CLDN8P56748 MOCS1-205ENST00000373195 2852 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CLDN8P56748 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CLDN8P56748 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CLDN8P56748 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CLDN8P56748 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CLDN8P56748 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CLDN8P56748 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CLDN8P56748 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CLDN8P56748 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CLDN8P56748 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CLDN8P56748 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
CLDN8P56748 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CLDN8P56748 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CLDN8P56748 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CLDN8P56748 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CLDN8P56748 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CLDN8P56748 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CLDN8P56748 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CLDN8P56748 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CLDN8P56748 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CLDN8P56748 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CLDN8P56748 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CLDN8P56748 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CLDN8P56748 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CLDN8P56748 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CLDN8P56748 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CLDN8P56748 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CLDN8P56748 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CLDN8P56748 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CLDN8P56748 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CLDN8P56748 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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