Protein–RNA interactions for Protein: P55773

CCL23, C-C motif chemokine 23, humanhuman

Predictions only

Length 120 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL23P55773 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCL23P55773 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCL23P55773 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCL23P55773 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCL23P55773 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCL23P55773 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCL23P55773 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCL23P55773 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCL23P55773 OR1J1-201ENST00000259357 969 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCL23P55773 CAPZB-201ENST00000264202 858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCL23P55773 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCL23P55773 SUMO1-204ENST00000409181 784 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCL23P55773 SUMO1-207ENST00000409498 779 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCL23P55773 LINC01006-202ENST00000418309 640 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCL23P55773 AL021707.5-201ENST00000420118 461 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCL23P55773 MIR663AHG-201ENST00000427348 1213 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCL23P55773 AC098935.1-201ENST00000446057 611 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CCL23P55773 AC073150.1-201ENST00000450406 1084 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CCL23P55773 NOC2LP1-201ENST00000450578 752 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CCL23P55773 AC005234.1-201ENST00000457851 434 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCL23P55773 RN7SL181P-201ENST00000462921 277 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CCL23P55773 RCC2P8-201ENST00000502779 1035 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CCL23P55773 SMIM23-202ENST00000523047 573 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCL23P55773 AC117500.3-201ENST00000537032 666 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCL23P55773 AL031282.1-201ENST00000577672 409 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCL23P55773 AL645941.3-201ENST00000580587 577 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCL23P55773 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCL23P55773 AC103691.2-201ENST00000618824 433 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CCL23P55773 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCL23P55773 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCL23P55773 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCL23P55773 BRMS1-201ENST00000359957 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCL23P55773 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCL23P55773 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCL23P55773 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCL23P55773 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCL23P55773 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCL23P55773 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCL23P55773 SHC1P1-201ENST00000425230 1745 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CCL23P55773 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CCL23P55773 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCL23P55773 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCL23P55773 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CCL23P55773 LINC02405-201ENST00000512624 1361 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCL23P55773 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCL23P55773 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCL23P55773 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCL23P55773 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCL23P55773 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCL23P55773 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCL23P55773 TMEM106A-202ENST00000541594 1330 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCL23P55773 KLK11-207ENST00000594768 1347 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCL23P55773 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCL23P55773 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCL23P55773 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCL23P55773 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCL23P55773 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CCL23P55773 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCL23P55773 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCL23P55773 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCL23P55773 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCL23P55773 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCL23P55773 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCL23P55773 CELA3B-201ENST00000337107 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCL23P55773 VPS29-201ENST00000360579 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCL23P55773 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCL23P55773 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCL23P55773 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CCL23P55773 AC114501.1-201ENST00000445949 172 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CCL23P55773 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCL23P55773 SIRT3-210ENST00000529382 1225 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCL23P55773 AC242376.1-201ENST00000559033 726 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CCL23P55773 DUX4L46-201ENST00000566845 751 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CCL23P55773 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCL23P55773 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCL23P55773 AL031665.1-201ENST00000619766 572 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCL23P55773 COX6A1P2-201ENST00000620597 330 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CCL23P55773 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCL23P55773 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCL23P55773 DLG1-AS1-202ENST00000430666 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCL23P55773 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCL23P55773 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCL23P55773 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCL23P55773 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCL23P55773 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCL23P55773 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCL23P55773 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCL23P55773 ELAVL1-205ENST00000596459 1473 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCL23P55773 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCL23P55773 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCL23P55773 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCL23P55773 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CCL23P55773 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCL23P55773 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CCL23P55773 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCL23P55773 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCL23P55773 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCL23P55773 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCL23P55773 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCL23P55773 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.9 ms