Protein–RNA interactions for Protein: P55290

CDH13, Cadherin-13, humanhuman

Predictions only

Length 713 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH13P55290 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CDH13P55290 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CDH13P55290 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CDH13P55290 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CDH13P55290 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CDH13P55290 SLC1A7-206ENST00000620347 2873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CDH13P55290 ZC3HAV1-204ENST00000471652 3182 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CDH13P55290 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CDH13P55290 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CDH13P55290 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
CDH13P55290 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC15.05■□□□□ 0
CDH13P55290 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC15.05■□□□□ 0
CDH13P55290 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CDH13P55290 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CDH13P55290 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CDH13P55290 PHAX-201ENST00000297540 4288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CDH13P55290 ATXN2L-202ENST00000336783 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CDH13P55290 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CDH13P55290 GREM1-202ENST00000560830 2648 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
CDH13P55290 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
CDH13P55290 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
CDH13P55290 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CDH13P55290 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CDH13P55290 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CDH13P55290 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CDH13P55290 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CDH13P55290 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CDH13P55290 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CDH13P55290 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CDH13P55290 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CDH13P55290 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CDH13P55290 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CDH13P55290 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CDH13P55290 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
CDH13P55290 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
CDH13P55290 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CDH13P55290 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CDH13P55290 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CDH13P55290 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CDH13P55290 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CDH13P55290 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CDH13P55290 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
CDH13P55290 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CDH13P55290 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
CDH13P55290 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CDH13P55290 ASTN2-206ENST00000361477 4001 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CDH13P55290 PPIL6-202ENST00000424445 4031 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CDH13P55290 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CDH13P55290 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
CDH13P55290 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
CDH13P55290 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CDH13P55290 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CDH13P55290 RTEL1-201ENST00000318100 4676 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CDH13P55290 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CDH13P55290 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CDH13P55290 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CDH13P55290 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CDH13P55290 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CDH13P55290 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CDH13P55290 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CDH13P55290 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CDH13P55290 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CDH13P55290 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CDH13P55290 IMPACT-201ENST00000284202 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CDH13P55290 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CDH13P55290 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CDH13P55290 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CDH13P55290 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CDH13P55290 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CDH13P55290 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CDH13P55290 LINC01184-204ENST00000501702 2977 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CDH13P55290 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CDH13P55290 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CDH13P55290 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CDH13P55290 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CDH13P55290 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CDH13P55290 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CDH13P55290 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CDH13P55290 ZFY-201ENST00000155093 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CDH13P55290 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CDH13P55290 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CDH13P55290 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CDH13P55290 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CDH13P55290 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CDH13P55290 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CDH13P55290 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CDH13P55290 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CDH13P55290 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
CDH13P55290 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CDH13P55290 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CDH13P55290 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CDH13P55290 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CDH13P55290 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CDH13P55290 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
CDH13P55290 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CDH13P55290 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
CDH13P55290 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
CDH13P55290 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CDH13P55290 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CDH13P55290 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms