Protein–RNA interactions for Protein: P55008

AIF1, Allograft inflammatory factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AIF1P55008 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
AIF1P55008 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
AIF1P55008 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
AIF1P55008 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
AIF1P55008 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
AIF1P55008 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
AIF1P55008 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
AIF1P55008 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
AIF1P55008 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
AIF1P55008 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
AIF1P55008 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
AIF1P55008 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
AIF1P55008 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
AIF1P55008 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
AIF1P55008 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
AIF1P55008 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
AIF1P55008 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
AIF1P55008 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
AIF1P55008 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
AIF1P55008 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
AIF1P55008 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
AIF1P55008 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
AIF1P55008 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
AIF1P55008 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
AIF1P55008 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
AIF1P55008 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
AIF1P55008 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
AIF1P55008 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
AIF1P55008 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
AIF1P55008 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
AIF1P55008 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
AIF1P55008 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
AIF1P55008 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
AIF1P55008 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
AIF1P55008 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
AIF1P55008 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
AIF1P55008 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
AIF1P55008 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
AIF1P55008 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
AIF1P55008 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
AIF1P55008 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
AIF1P55008 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
AIF1P55008 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
AIF1P55008 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
AIF1P55008 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
AIF1P55008 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
AIF1P55008 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
AIF1P55008 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
AIF1P55008 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
AIF1P55008 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
AIF1P55008 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
AIF1P55008 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
AIF1P55008 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
AIF1P55008 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
AIF1P55008 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
AIF1P55008 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
AIF1P55008 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
AIF1P55008 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
AIF1P55008 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
AIF1P55008 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
AIF1P55008 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
AIF1P55008 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
AIF1P55008 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
AIF1P55008 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
AIF1P55008 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
AIF1P55008 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
AIF1P55008 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
AIF1P55008 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
AIF1P55008 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
AIF1P55008 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
AIF1P55008 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
AIF1P55008 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
AIF1P55008 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
AIF1P55008 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
AIF1P55008 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
AIF1P55008 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
AIF1P55008 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
AIF1P55008 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
AIF1P55008 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
AIF1P55008 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
AIF1P55008 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
AIF1P55008 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
AIF1P55008 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
AIF1P55008 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
AIF1P55008 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
AIF1P55008 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
AIF1P55008 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
AIF1P55008 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
AIF1P55008 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
AIF1P55008 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
AIF1P55008 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
AIF1P55008 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
AIF1P55008 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
AIF1P55008 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
AIF1P55008 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
AIF1P55008 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
AIF1P55008 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
AIF1P55008 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
AIF1P55008 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
AIF1P55008 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms