Protein–RNA interactions for Protein: P51531

SMARCA2, Probable global transcription activator SNF2L2, humanhuman

Predictions only

Length 1,590 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA2P51531 AC242426.4-201ENST00000606856 573 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SMARCA2P51531 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SMARCA2P51531 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SMARCA2P51531 LETMD1-235ENST00000552739 1713 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SMARCA2P51531 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SMARCA2P51531 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SMARCA2P51531 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SMARCA2P51531 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SMARCA2P51531 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SMARCA2P51531 GJB1-203ENST00000374029 1587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SMARCA2P51531 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SMARCA2P51531 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SMARCA2P51531 Metazoa_SRP.6-201ENST00000366384 298 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
SMARCA2P51531 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SMARCA2P51531 DDX39AP1-201ENST00000445147 1181 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
SMARCA2P51531 RHEB-207ENST00000496004 744 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SMARCA2P51531 AC105390.1-201ENST00000511330 560 ntTSL 4 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SMARCA2P51531 HIST2H2BF-204ENST00000545683 999 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SMARCA2P51531 AC138701.2-201ENST00000553634 226 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
SMARCA2P51531 SLC25A21-203ENST00000555449 1023 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SMARCA2P51531 MIR2392-201ENST00000584881 84 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
SMARCA2P51531 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SMARCA2P51531 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SMARCA2P51531 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SMARCA2P51531 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SMARCA2P51531 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SMARCA2P51531 ELP5-203ENST00000396627 1389 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SMARCA2P51531 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SMARCA2P51531 FAS-202ENST00000352159 1722 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SMARCA2P51531 SCAF11-203ENST00000395453 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SMARCA2P51531 CCDC51-206ENST00000447018 1461 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SMARCA2P51531 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SMARCA2P51531 GTF3C6-201ENST00000329970 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SMARCA2P51531 TAC3-208ENST00000441881 731 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SMARCA2P51531 SHANK2-210ENST00000449116 939 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SMARCA2P51531 TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 181 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
SMARCA2P51531 TAC3-211ENST00000615887 1120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SMARCA2P51531 ADSL-201ENST00000216194 1620 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SMARCA2P51531 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SMARCA2P51531 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SMARCA2P51531 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SMARCA2P51531 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SMARCA2P51531 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SMARCA2P51531 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SMARCA2P51531 VAMP2-202ENST00000404970 1479 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SMARCA2P51531 COLEC11-203ENST00000382062 1633 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SMARCA2P51531 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SMARCA2P51531 LCE3B-201ENST00000335633 288 ntAPPRIS P1 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SMARCA2P51531 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SMARCA2P51531 AL365436.2-201ENST00000434112 526 ntTSL 4 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SMARCA2P51531 CD59-210ENST00000528700 652 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SMARCA2P51531 PSME2-201ENST00000216802 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SMARCA2P51531 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SMARCA2P51531 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SMARCA2P51531 ANXA8L1-202ENST00000611655 1398 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SMARCA2P51531 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SMARCA2P51531 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SMARCA2P51531 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SMARCA2P51531 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SMARCA2P51531 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SMARCA2P51531 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SMARCA2P51531 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SMARCA2P51531 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SMARCA2P51531 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SMARCA2P51531 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SMARCA2P51531 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SMARCA2P51531 TRBJ2-6-201ENST00000390418 53 ntAPPRIS P1 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SMARCA2P51531 AL137058.1-201ENST00000418237 673 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SMARCA2P51531 AL390778.2-201ENST00000420883 886 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SMARCA2P51531 AC114488.1-201ENST00000435872 591 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SMARCA2P51531 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SMARCA2P51531 SPO11-203ENST00000371263 1834 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SMARCA2P51531 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SMARCA2P51531 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SMARCA2P51531 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SMARCA2P51531 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SMARCA2P51531 ELOVL1-201ENST00000372458 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SMARCA2P51531 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
SMARCA2P51531 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SMARCA2P51531 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SMARCA2P51531 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SMARCA2P51531 SPATA8-201ENST00000328504 1083 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SMARCA2P51531 PHACTR2-204ENST00000397980 745 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SMARCA2P51531 AC093909.3-201ENST00000504783 336 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
SMARCA2P51531 ANAPC15-217ENST00000545944 704 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SMARCA2P51531 AC136944.4-201ENST00000568893 660 ntTSL 4 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SMARCA2P51531 TMEM98-205ENST00000578289 806 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SMARCA2P51531 PSMD5-208ENST00000625444 219 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SMARCA2P51531 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SMARCA2P51531 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SMARCA2P51531 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SMARCA2P51531 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SMARCA2P51531 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SMARCA2P51531 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SMARCA2P51531 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SMARCA2P51531 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SMARCA2P51531 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SMARCA2P51531 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SMARCA2P51531 ALG11-203ENST00000523764 1404 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SMARCA2P51531 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.5 ms