Protein–RNA interactions for Protein: P49959

MRE11, Double-strand break repair protein MRE11, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRE11P49959 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
MRE11P49959 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
MRE11P49959 KCTD10-208ENST00000540089 3096 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
MRE11P49959 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC18■□□□□ 0.47
MRE11P49959 ZNF619-201ENST00000314686 2233 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
MRE11P49959 AC126335.2-201ENST00000623362 4637 ntBASIC18■□□□□ 0.47
MRE11P49959 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
MRE11P49959 ATE1-202ENST00000369040 4803 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
MRE11P49959 POU6F1-208ENST00000550824 2664 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
MRE11P49959 OSMR-201ENST00000274276 5539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MRE11P49959 UBE3A-207ENST00000614096 8741 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MRE11P49959 CLIP2-203ENST00000395060 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MRE11P49959 AC068888.1-207ENST00000546793 2863 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
MRE11P49959 TRPV4-202ENST00000418703 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MRE11P49959 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
MRE11P49959 CSNK1A1P1-201ENST00000430593 2147 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MRE11P49959 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
MRE11P49959 CABP4-201ENST00000325656 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MRE11P49959 SIDT1-201ENST00000264852 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
MRE11P49959 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MRE11P49959 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
MRE11P49959 MYH6-202ENST00000405093 5941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
MRE11P49959 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MRE11P49959 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
MRE11P49959 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
MRE11P49959 SOAT1-203ENST00000539888 6794 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
MRE11P49959 AC092535.1-201ENST00000417557 2165 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
MRE11P49959 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MRE11P49959 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MRE11P49959 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
MRE11P49959 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
MRE11P49959 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MRE11P49959 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MRE11P49959 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
MRE11P49959 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
MRE11P49959 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MRE11P49959 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
MRE11P49959 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MRE11P49959 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
MRE11P49959 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
MRE11P49959 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
MRE11P49959 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MRE11P49959 ITGB2-203ENST00000355153 2913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
MRE11P49959 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MRE11P49959 RAP1GAP-211ENST00000495204 2489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MRE11P49959 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
MRE11P49959 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MRE11P49959 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MRE11P49959 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MRE11P49959 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MRE11P49959 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MRE11P49959 MINDY1-207ENST00000622754 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MRE11P49959 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MRE11P49959 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
MRE11P49959 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
MRE11P49959 TGIF2-201ENST00000373872 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MRE11P49959 FGR-204ENST00000399173 2483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
MRE11P49959 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MRE11P49959 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MRE11P49959 USP17L2-201ENST00000333796 1910 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
MRE11P49959 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MRE11P49959 APLP2-203ENST00000338167 3270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MRE11P49959 DSN1-207ENST00000448110 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
MRE11P49959 WNT3A-201ENST00000284523 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MRE11P49959 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MRE11P49959 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MRE11P49959 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
MRE11P49959 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MRE11P49959 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MRE11P49959 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MRE11P49959 VAMP4-202ENST00000367740 1193 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MRE11P49959 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
MRE11P49959 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
MRE11P49959 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
MRE11P49959 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
MRE11P49959 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
MRE11P49959 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MRE11P49959 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
MRE11P49959 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
MRE11P49959 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
MRE11P49959 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
MRE11P49959 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
MRE11P49959 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
MRE11P49959 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MRE11P49959 ATRN-202ENST00000446916 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MRE11P49959 PADI2-202ENST00000375486 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MRE11P49959 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MRE11P49959 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MRE11P49959 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MRE11P49959 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MRE11P49959 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
MRE11P49959 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MRE11P49959 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MRE11P49959 ANO10-205ENST00000414522 2450 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
MRE11P49959 FBXO34-201ENST00000313833 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MRE11P49959 NTRK2-202ENST00000304053 8226 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MRE11P49959 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MRE11P49959 KLF11-205ENST00000535335 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
MRE11P49959 PRKD2-202ENST00000433867 3321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
MRE11P49959 TMPRSS2-202ENST00000398585 3240 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.1 ms