Protein–RNA interactions for Protein: P49662

CASP4, Caspase-4, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP4P49662 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CASP4P49662 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CASP4P49662 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CASP4P49662 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CASP4P49662 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CASP4P49662 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CASP4P49662 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CASP4P49662 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CASP4P49662 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CASP4P49662 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CASP4P49662 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CASP4P49662 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CASP4P49662 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CASP4P49662 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CASP4P49662 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CASP4P49662 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CASP4P49662 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CASP4P49662 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CASP4P49662 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CASP4P49662 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CASP4P49662 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CASP4P49662 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CASP4P49662 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CASP4P49662 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CASP4P49662 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CASP4P49662 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CASP4P49662 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CASP4P49662 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CASP4P49662 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CASP4P49662 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CASP4P49662 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CASP4P49662 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CASP4P49662 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CASP4P49662 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CASP4P49662 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CASP4P49662 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CASP4P49662 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CASP4P49662 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CASP4P49662 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CASP4P49662 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CASP4P49662 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CASP4P49662 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CASP4P49662 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CASP4P49662 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CASP4P49662 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CASP4P49662 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CASP4P49662 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CASP4P49662 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CASP4P49662 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CASP4P49662 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CASP4P49662 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CASP4P49662 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CASP4P49662 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CASP4P49662 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CASP4P49662 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CASP4P49662 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CASP4P49662 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CASP4P49662 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CASP4P49662 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CASP4P49662 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CASP4P49662 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CASP4P49662 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CASP4P49662 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CASP4P49662 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CASP4P49662 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CASP4P49662 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CASP4P49662 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CASP4P49662 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CASP4P49662 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CASP4P49662 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CASP4P49662 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CASP4P49662 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CASP4P49662 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CASP4P49662 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CASP4P49662 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CASP4P49662 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CASP4P49662 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CASP4P49662 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CASP4P49662 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CASP4P49662 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CASP4P49662 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CASP4P49662 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CASP4P49662 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CASP4P49662 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CASP4P49662 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CASP4P49662 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CASP4P49662 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CASP4P49662 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CASP4P49662 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CASP4P49662 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CASP4P49662 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CASP4P49662 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CASP4P49662 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CASP4P49662 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CASP4P49662 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CASP4P49662 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CASP4P49662 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CASP4P49662 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CASP4P49662 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CASP4P49662 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 127.7 ms