Protein–RNA interactions for Protein: P40425

PBX2, Pre-B-cell leukemia transcription factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 430 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PBX2P40425 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PBX2P40425 CTSW-204ENST00000528419 1341 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PBX2P40425 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PBX2P40425 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PBX2P40425 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PBX2P40425 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PBX2P40425 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PBX2P40425 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PBX2P40425 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PBX2P40425 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PBX2P40425 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PBX2P40425 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PBX2P40425 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PBX2P40425 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PBX2P40425 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PBX2P40425 RPP25L-202ENST00000378959 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PBX2P40425 ETV2-201ENST00000379023 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PBX2P40425 AL365436.2-201ENST00000434112 526 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PBX2P40425 AC004869.1-201ENST00000440935 540 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PBX2P40425 AC012441.2-201ENST00000444843 739 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
PBX2P40425 IMPA1-203ENST00000449740 1180 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PBX2P40425 AC135178.1-201ENST00000458568 537 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PBX2P40425 CDC23-208ENST00000505120 455 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PBX2P40425 C8orf31-207ENST00000524181 1199 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PBX2P40425 RN7SL596P-201ENST00000582123 288 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
PBX2P40425 NAT9-220ENST00000582870 896 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PBX2P40425 UXT-AS1-202ENST00000591832 565 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PBX2P40425 AP003392.6-201ENST00000607709 325 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
PBX2P40425 AC073911.3-201ENST00000624401 631 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
PBX2P40425 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PBX2P40425 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PBX2P40425 MANEAL-201ENST00000329006 1930 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PBX2P40425 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PBX2P40425 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PBX2P40425 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PBX2P40425 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PBX2P40425 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PBX2P40425 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PBX2P40425 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PBX2P40425 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PBX2P40425 ZCCHC17-204ENST00000546109 1705 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PBX2P40425 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PBX2P40425 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PBX2P40425 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PBX2P40425 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PBX2P40425 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PBX2P40425 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PBX2P40425 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PBX2P40425 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PBX2P40425 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PBX2P40425 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PBX2P40425 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PBX2P40425 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PBX2P40425 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PBX2P40425 FXYD5-201ENST00000342879 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PBX2P40425 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PBX2P40425 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PBX2P40425 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PBX2P40425 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PBX2P40425 CRYBB1-201ENST00000215939 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PBX2P40425 RASSF3-202ENST00000336061 1030 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PBX2P40425 RPS9-204ENST00000391753 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PBX2P40425 CSHL1-205ENST00000438387 566 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PBX2P40425 AC130709.1-201ENST00000484779 1212 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
PBX2P40425 NDUFS6P1-201ENST00000485187 316 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
PBX2P40425 AL132639.2-202ENST00000553520 467 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PBX2P40425 AF111169.4-201ENST00000556368 749 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PBX2P40425 AC090519.2-201ENST00000559034 655 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PBX2P40425 NRN1L-202ENST00000576147 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PBX2P40425 AC008133.1-201ENST00000584688 557 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PBX2P40425 MIR4522-201ENST00000584932 87 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
PBX2P40425 SNRPD2-206ENST00000588301 702 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PBX2P40425 AC022960.2-201ENST00000616300 666 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
PBX2P40425 MIR6769A-201ENST00000617340 73 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
PBX2P40425 FO393412.1-201ENST00000619841 382 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
PBX2P40425 OR10R2-202ENST00000641067 1132 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PBX2P40425 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PBX2P40425 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PBX2P40425 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PBX2P40425 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PBX2P40425 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PBX2P40425 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PBX2P40425 AGER-201ENST00000375055 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PBX2P40425 PCNA-202ENST00000379160 1359 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PBX2P40425 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PBX2P40425 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PBX2P40425 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PBX2P40425 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PBX2P40425 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PBX2P40425 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PBX2P40425 Z84468.1-201ENST00000626321 1408 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PBX2P40425 APBB3-205ENST00000412920 1455 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PBX2P40425 CRLF2-201ENST00000381566 1545 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PBX2P40425 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PBX2P40425 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PBX2P40425 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PBX2P40425 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PBX2P40425 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
PBX2P40425 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PBX2P40425 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.2 ms