Protein–RNA interactions for Protein: P33241

LSP1, Lymphocyte-specific protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSP1P33241 SLC4A7-214ENST00000455077 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LSP1P33241 USH1C-201ENST00000005226 2700 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LSP1P33241 GOPC-201ENST00000052569 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LSP1P33241 RPTOR-202ENST00000544334 5734 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LSP1P33241 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LSP1P33241 AL139385.1-201ENST00000611744 3272 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
LSP1P33241 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LSP1P33241 GLB1L3-201ENST00000389887 3566 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LSP1P33241 ST3GAL5-203ENST00000393805 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LSP1P33241 CBFA2T3-202ENST00000327483 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LSP1P33241 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LSP1P33241 IFNA6-202ENST00000380210 1544 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LSP1P33241 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LSP1P33241 TBC1D1-201ENST00000261439 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LSP1P33241 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LSP1P33241 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LSP1P33241 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LSP1P33241 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LSP1P33241 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LSP1P33241 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LSP1P33241 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LSP1P33241 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LSP1P33241 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LSP1P33241 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
LSP1P33241 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LSP1P33241 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
LSP1P33241 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LSP1P33241 C1QTNF1-204ENST00000392445 2833 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LSP1P33241 ATE1-201ENST00000224652 4930 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LSP1P33241 GRIN1-203ENST00000371550 3940 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LSP1P33241 DPP8-202ENST00000321147 3125 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LSP1P33241 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LSP1P33241 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LSP1P33241 GCM2-201ENST00000379491 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LSP1P33241 FGD6-203ENST00000546711 4568 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LSP1P33241 AP1G2-201ENST00000308724 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LSP1P33241 CENPBD1-201ENST00000314994 2744 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LSP1P33241 SPOCK3-218ENST00000511531 2908 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LSP1P33241 CABLES2-201ENST00000279101 3785 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LSP1P33241 NEK10-206ENST00000429845 4250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LSP1P33241 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
LSP1P33241 KLHL33-203ENST00000637228 5404 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LSP1P33241 SLC22A2-202ENST00000366953 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LSP1P33241 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LSP1P33241 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LSP1P33241 ARMCX2-201ENST00000328766 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LSP1P33241 ZNF717-204ENST00000478296 3875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LSP1P33241 TOX2-202ENST00000358131 2605 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LSP1P33241 LRP8-201ENST00000306052 7648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LSP1P33241 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LSP1P33241 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LSP1P33241 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LSP1P33241 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
LSP1P33241 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LSP1P33241 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LSP1P33241 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
LSP1P33241 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LSP1P33241 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LSP1P33241 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LSP1P33241 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LSP1P33241 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LSP1P33241 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LSP1P33241 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LSP1P33241 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LSP1P33241 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LSP1P33241 NUP98-201ENST00000324932 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LSP1P33241 ZBED1-203ENST00000381223 4510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LSP1P33241 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LSP1P33241 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LSP1P33241 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
LSP1P33241 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LSP1P33241 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LSP1P33241 AC007240.1-201ENST00000641498 1996 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LSP1P33241 RHOH-224ENST00000622175 2254 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LSP1P33241 METTL13-203ENST00000367737 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LSP1P33241 ZNRF3-202ENST00000406323 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LSP1P33241 GPR88-201ENST00000315033 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LSP1P33241 ADAM33-201ENST00000350009 3480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LSP1P33241 SLC35G1-201ENST00000371408 3490 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LSP1P33241 DNM1-212ENST00000627543 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LSP1P33241 PML-201ENST00000268058 4508 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LSP1P33241 SACM1L-201ENST00000389061 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LSP1P33241 PRRT2-201ENST00000300797 3002 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LSP1P33241 SCNN1A-215ENST00000540037 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LSP1P33241 SLC35C2-203ENST00000372227 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LSP1P33241 HMOX2-216ENST00000613539 1703 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LSP1P33241 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LSP1P33241 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LSP1P33241 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LSP1P33241 RBBP8NL-201ENST00000252998 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LSP1P33241 MYH14-201ENST00000262269 3848 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LSP1P33241 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LSP1P33241 BICDL2-204ENST00000573514 3519 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LSP1P33241 AC073548.1-201ENST00000624088 1882 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
LSP1P33241 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LSP1P33241 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LSP1P33241 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LSP1P33241 SPACA9-203ENST00000372136 2536 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LSP1P33241 PAPOLA-201ENST00000216277 4519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LSP1P33241 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms