Protein–RNA interactions for Protein: P29466

CASP1, Caspase-1, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP1P29466 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CASP1P29466 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CASP1P29466 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CASP1P29466 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CASP1P29466 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CASP1P29466 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CASP1P29466 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CASP1P29466 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CASP1P29466 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CASP1P29466 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
CASP1P29466 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CASP1P29466 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CASP1P29466 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
CASP1P29466 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CASP1P29466 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CASP1P29466 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CASP1P29466 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
CASP1P29466 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CASP1P29466 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CASP1P29466 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CASP1P29466 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
CASP1P29466 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CASP1P29466 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CASP1P29466 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CASP1P29466 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CASP1P29466 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CASP1P29466 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CASP1P29466 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CASP1P29466 ESRP2-202ENST00000473183 3793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CASP1P29466 IARS2-201ENST00000366922 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CASP1P29466 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CASP1P29466 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CASP1P29466 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CASP1P29466 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CASP1P29466 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CASP1P29466 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CASP1P29466 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CASP1P29466 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CASP1P29466 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CASP1P29466 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CASP1P29466 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CASP1P29466 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CASP1P29466 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CASP1P29466 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CASP1P29466 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CASP1P29466 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CASP1P29466 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CASP1P29466 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CASP1P29466 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
CASP1P29466 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CASP1P29466 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CASP1P29466 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CASP1P29466 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CASP1P29466 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CASP1P29466 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CASP1P29466 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
CASP1P29466 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CASP1P29466 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CASP1P29466 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CASP1P29466 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
CASP1P29466 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CASP1P29466 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CASP1P29466 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CASP1P29466 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CASP1P29466 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CASP1P29466 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
CASP1P29466 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CASP1P29466 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CASP1P29466 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CASP1P29466 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CASP1P29466 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CASP1P29466 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
CASP1P29466 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CASP1P29466 ZC3HAV1-204ENST00000471652 3182 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CASP1P29466 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CASP1P29466 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CASP1P29466 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CASP1P29466 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
CASP1P29466 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CASP1P29466 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CASP1P29466 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CASP1P29466 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CASP1P29466 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CASP1P29466 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CASP1P29466 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CASP1P29466 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CASP1P29466 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CASP1P29466 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CASP1P29466 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CASP1P29466 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CASP1P29466 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CASP1P29466 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
CASP1P29466 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CASP1P29466 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CASP1P29466 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CASP1P29466 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CASP1P29466 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CASP1P29466 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CASP1P29466 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CASP1P29466 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms